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Mutated-?-actin restores growth to a yeast amino acid transport defective mutant

2000· article· en· W1967611858 sur OpenAlexaff
Ali Khamessan, Fakhraddin Naghibalhossaini, Masoud Vedadi, Rose M. Johnstone

Notice bibliographique

RevueJournal of Cellular Physiology · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFungal and yeast genetics research
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésComplementary DNABiologyMolecular biologycDNA libraryOpen reading frameProlineMutantAmino acidBiochemistryPeptide sequenceGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A mutated yeast cell 22574d lacking all three proline transporters, PUT4, UGA4, and GAP1, and incapable of growth on proline recovers its lost ability to grow on proline as sole nitrogen source when transformed with a mutagenized mouse γ-actin cDNA (M-γ-A). Native mouse γ-actin cDNA is ineffective. The 3′-region of γ-actin cDNA was mutagenized to resemble E51 cDNA previously isolated from Ehrlich tumor cells. The E51 cDNA has an extended reading frame in the 3′-region compared to that in native γ-actin. The extension of the open reading frame in E51 cDNA, was found to be due to an additional pair of bases (TG) at position 1104 of E51 cDNA. After site-directed mutagenesis of the 3′-region of native γ-actin cDNA to resemble that of E51 cDNA, the construct, M-γ-A cDNA, was expressed in the 22574d yeast. While the transformation with M-γ-A increased the uptake of both proline and γ-amino butyric acid, the transport of five other solutes was not changed by this transformation. Northern blotting of the nontransformed and the M-γ-A-transformed 22574d cells with gene-specific probes for the three proline transporters showed the expression of an mRNA for UGA4 in both transformed and nontransformed cells but no evidence for the expression of GAP1 or PUT4. The mRNA for UGA4 was expressed at a lower level in strain 22574d than in the parent yeast Σ1278b. Furthermore, the message in the mutated cells is smaller in size by about 15%. These results are consistent with the synthesis of a mutated transporter which requires the coexpression of M-γ-A, but not native γ-actin, to restore physiological function, i.e., proline or γ-amino acid transport. J. Cell. Physiol. 186:124–135, 2001. © 2001 Wiley-Liss, Inc.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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