Genetic Diversity of<i>Vibrio parahaemolyticus</i>from Narragansett Bay and Coastal Ponds of Rhode Island
Notice bibliographique
Résumé
Quantitative polymerase chain reaction studies have detected Vibrioparahaemolyticus virulence genes (hemolysins tdh and trh) in Rhode Island oysters and waters. Illness caused by V. parahaemolyticus is currently rare in Rhode Island; however, there is concern over increasing aquaculture and water temperatures. The aim of this study was to characterize further the genetic diversity of V. parahaemolyticus in Rhode Island to determine disease risk. The genetic profile of pathogenic (tdh and/or trh ) strains and environmental (tdh-/trh-) strains of V. parahaemolyticus isolated from Rhode Island oyster and water samples was compared with pandemic and clinical strains using repetitive extragenic palindromic polymerase chain reaction. Of the 291 V. parahaemolyticus colonies isolated, 27 were pathogenic strains, with 25 of 291 (9.0%), tdh-/trh ; 1 of 291 (0.3%), tdh /trh ; and 1 of 291 (0.3%), tdh /trh-. Rhode Island isolates did not cluster closely with pandemic or clinical strains. Isolates containing tdh and/or trh genes from Rhode Island waters were predominantly tdh-/trh , in contrast with a predominance of tdh /trh- or tdh /trh strains in Alaska, the Pacific Northwest, and the Gulf of Mexico. Similar to other studies in the United States, a high level of genetic diversity in pathogenic and environmental strains of V. parahaemolyticus was seen. This study clarified the diversity and virulence gene content (tdh and trh status) of V. parahaemolyticus isolates from Rhode Island waters.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».