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Enregistrement W1968471163 · doi:10.1074/jbc.m309414200

Quantitative Evaluation of the Contribution of Weak Lysine-binding Sites Present within Apolipoprotein(a) Kringle IV Types 6–8 to Lipoprotein(a) Assembly

2004· article· en· W1968471163 sur OpenAlexafffund
Lev Becker, P. Michael Cook, Theodore G. Wright, Marlys L. Koschinsky

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueClick Chemistry and Applications
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesQueen's University
Mots-clésLysineApolipoprotein BLipoprotein(a)LipoproteinChemistryBiochemistryAmino acidCholesterol

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

During lipoprotein(a) (Lp(a)) assembly, non-covalent interactions between apolipoprotein(a) (apo(a)) and low density lipoprotein precede specific disulfide bond formation. Studies have shown that the non-covalent step involves an interaction between the weak lysine-binding sites (WLBS) present within each of apo(a) kringle IV types 6, 7, and 8 (KIV(6-8)), and two lysine residues (Lys(680) and Lys(690)) within the NH(2) terminus of the apolipoprotein B-100 (apoB) component of low density lipoprotein. In the present study, we introduced single point mutations (E56G) into each of the WLBS present in apo(a) KIV(6-8) and expressed these mutations in the context of a 17-kringle (17K) recombinant apo(a) variant. Single mutations that disrupt the WLBS in KIV(6), KIV(7), and KIV(8), as well as mutants that disrupt the WLBS in both KIV(6) and KIV(7), or both KIV(7) and KIV(8), were assessed for their ability to form non-covalent and covalent Lp(a) complexes. Our results demonstrate that both apo(a) KIV(7) and KIV(8), but not KIV(6), are required for maximally efficient non-covalent and covalent Lp(a) assembly. Single mutations in the WLBS of KIV(7) or KIV(8) resulted in a 3-fold decrease in the affinity of 17K recombinant apo(a) for apoB, and a 20% reduction in the rate of covalent Lp(a) formation. Tandem mutations in the WLBS in both KIV(7) and KIV(8) resulted in a 13-fold reduction in the binding affinity between apo(a) and apoB, and a 75% reduction in the rate of the covalent step of Lp(a) formation. We also showed that KIV(7) and KIV(8) specifically bind with high affinity to apoB-derived peptides containing Lys(690) or Lys(680), respectively. Taken together, our data demonstrate that specific interactions between apo(a) KIV(7) and KIV(8) and Lys(680) and Lys(690) in apoB mediate a high affinity non-covalent interaction between apo(a) and low density lipoprotein, which dictates the efficiency of covalent Lp(a) formation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,065
Tête enseignante GPT0,333
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations48
Publié2004
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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