Characterization of Proline, Citrulline, and Uracil Auxotrophic Plasmid-Carrying Neisseria gonorrhoeae Strains in Canada, 1993–2003
Notice bibliographique
Résumé
In Brief Background and Objective: Proline, citrulline, and uracil (PCU−) Neisseria gonorrhoeae is a common auxotroph in Canada and resistance to antibiotics in this auxotroph is rare. Goal: The goal of this study was to determine the characteristics of the PCU− strains that have plasmids. Study Design: PCU− strains sent between 1993 and 2003 for reference work to the National Microbiology Laboratory were analyzed for their plasmid profiles and antimicrobial susceptibilities. PCU− strains containing plasmids and/or antimicrobial resistant were serotyped, and por and tbpB genes were sequenced to determine their antigenic types. Results: Forty strains containing plasmids were identified; serotype IB-11 and por/tbpB sequence type 2 was the most common pattern (28 of 40 strains [70%]). One strain had plasmids that conferred resistance to penicillin and tetracycline and 4 plasmidless strains were resistant to tetracycline. Conclusion: PCU− auxotrophic N. gonorrhoeae carrying plasmids and/or that have chromosomal genes mutated to resist antimicrobials have been identified in Canada. This shows the competency of this pathogen to survive under antimicrobial pressure and the importance of continuous surveillance. Characterization of proline, citrulline, and uracil requiring auxotrophs of Neisseria gonorrhoeae strains collected during 1993–2003 showed some of these strains either contained plasmids or had chromosomal and/or plasmid-mediated resistance.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».