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Enregistrement W1968956551 · doi:10.1097/00005768-200105001-00298

TRANSCRIPTION FACTORS WHICH BIND TO GC-RICH REGIONS ARE IMPORTANT IN MUSCLE MITOCHONDRIAL BIOGENESIS

2001· article· en· W1968956551 sur OpenAlexaff
Isabella Irrcher, Lázaro Alessandro Soares Nunes, Damien Freyssenet, Michael K. Connor, David A. Hood

Notice bibliographique

RevueMedicine & Science in Sports & Exercise · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Bioinformatics, and Biomedical Research
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMessenger RNACytochrome cMolecular biologyMitochondrial biogenesisBiologyTranscription (linguistics)CytochromeMitochondrionCytosolTranscription factorGeneCell biologyBiochemistryEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The transcription factors zif268 and Sp1 bind to GC-rich regions in the promoters of nuclear genes encoding mitochondrial proteins. We treated cells with the calcium ionophore A23187 and overexpressed zif268 and Sp1 to evaluate their roles in mitochondrial biogenesis. A23187 treatment has been shown to augment cytochrome c mRNA levels by 70% in rat L6 muscle cells. A23187 induced a rapid and transient 150% increase in zif268 mRNA which peaked 1–2 hours after treatment. Serum response factor (SRF) mRNA increased by 80% (P < 0.05) with a maximum at 4 hours, and declined by 48 hours of treatment. A23187 also induced 50% and 90% increases in mRNAs encoding malate dehydrogenase (MDH) and the beta subunit of F-ATPase (BETA) by 48 hours. In contrast, A23187 treatment resulted in a 19% reduction (P < 0.05) in glutamate dehydrogenase (GDH) mRNA. Overexpression of zif268 led to a 37% decline (P < 0.05) in GDH mRNA, and a 2.2-fold increase (P < 0.05) in cytochrome c mRNA, but had no effect on the mRNAs encoding MDH or BETA. The effect on cytochrome c mRNA was mediated via increased mRNA stability, rather than increased transcription. In contrast, overexpression of Sp1 also increased cytochrome c mRNA, but this appeared to be via transcriptional activation. These data are consistent with a role for zif268 in mediating the A23187 effect on cytochrome c and GDH, but not on MDH or BETA. In addition, Sp1 acts directly, whereas zif268 acts indirectly, to increase cytochrome c mRNA during forced overexpression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,283
Score d'incertitude au seuil0,770

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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