Effects of Phospholamban Transmembrane Mutants on the Calcium Affinity, Maximal Activity, and Cooperativity of the Sarcoplasmic Reticulum Calcium Pump
Notice bibliographique
Résumé
Regulation of the SERCA calcium pump by phospholamban (PLB) is largely due to interactions between their respective transmembrane domains. In spite of numerous mutagenesis and kinetic studies, we still do not have a clear mechanistic picture of how PLB influences the calcium transport cycle of SERCA. Herein, we have created alanine mutants for each residue in the transmembrane domain of PLB, we have co-reconstituted these mutants with SERCA into proteoliposomes, and we have performed kinetic simulations of the calcium-dependent ATPase activity isotherms. The PLB transmembrane mutants had a variable effect on the calcium affinity, maximal activity, and cooperativity of SERCA, such that a range of values was observed. Kinetic simulations using a well-established reaction scheme for SERCA then allowed us to correlate the effects on SERCA activity with changes in the reaction scheme rate constants. Only three steps in the reaction scheme were affected by the presence of PLB, namely, binding of the first calcium ion, a subsequent conformational change in SERCA, and binding of the second calcium ion. The ability of wild-type and mutant forms of PLB to alter the apparent calcium affinity of SERCA correlated with a decreased rate of binding of the second calcium ion. In addition, the ability of wild-type and mutant forms of PLB to alter the maximal activity of SERCA correlated with a change in the forward rate constant for the slow conformational change in SERCA following binding of the first calcium ion.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».