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Enregistrement W1969592309 · doi:10.1158/1055-9965.epi-07-0129

<i>AURKA</i>F31I Polymorphism and Breast Cancer Risk in<i>BRCA1</i>and<i>BRCA2</i>Mutation Carriers: A Consortium of Investigators of Modifiers of BRCA1/2 Study

2007· article· en· W1969592309 sur OpenAlexaff
Fergus J. Couch, Olga M. Sinilnikova, Robert A. Vierkant, V. Shane Pankratz, Zachary S. Fredericksen, Dominique Stoppa‐Lyonnet, Isabelle Coupier, David J. Hughes, Agnès Hardouin, Pascaline Berthet, Susan Peock, Margaret Cook, Caroline Baynes, Shirley Hodgson, Patrick J. Morrison, Mary Porteous, Anna Jakubowska, Jan Lubiński, Jacek Gronwald, Amanda B. Spurdle, Rita K. Schmutzler, Beatrix Versmold, Christoph Engel, Alfons Meindl, Christian Sutter, Jürgen Horst, Dieter Schaefer, Kenneth Offit, Tomas Kirchhoff, Irene L. Andrulis, Eduard Ilyushik, Gordon Glendon, Peter Devilee, Maaike P.G. Vreeswijk, Hans F. A. Vasen, Åke Borg, Katja Backenhorn, Jeffery P. Struewing, Mark H. Greene, Susan L. Neuhausen, Timothy R. Rebbeck, Katherine L. Nathanson, Susan M. Domchek, Theresa Wagner, Judy E. Garber, Csilla I. Szabo, Michal Zikán, Lenka Foretová, Janet E. Olson, Thomas A. Sellers, Noralane M. Lindor, Heli Nevanlinna, Johanna Tommiska, Kristiina Aittomäki, Ute Hamann, Muhammad Usman Rashid, Diana Torres, Jacques Simard, Francine Durocher, Frédéric Guénard, Henry T. Lynch, Claudine Isaacs, Jeffrey N. Weitzel, Olufunmilayo I. Olopade, Steven A. Narod, Mary B. Daly, Andrew K. Godwin, Gail E. Tomlinson, Douglas F. Easton, Georgia Chenevix‐Trench, Antonis C. Antoniou

Notice bibliographique

RevueCancer Epidemiology Biomarkers & Prevention · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensCoalition for Research in Women's HealthUniversité LavalCancer Care OntarioCentre hospitalier universitaire de QuébecLunenfeld-Tanenbaum Research Institute
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesMedical Research CouncilNational Health and Medical Research CouncilLeids Universitair Medisch CentrumNational Breast Cancer FoundationNational Cancer InstituteCancer Research UK
Mots-clésBreast cancerOncologyHazard ratioMedicineInternal medicineCancerBRCA mutationAlleleCancer researchConfidence intervalBiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The AURKA oncogene is associated with abnormal chromosome segregation and aneuploidy and predisposition to cancer. Amplification of AURKA has been detected at higher frequency in tumors from BRCA1 and BRCA2 mutation carriers than in sporadic breast tumors, suggesting that overexpression of AURKA and inactivation of BRCA1 and BRCA2 cooperate during tumor development and progression. The F31I polymorphism in AURKA has been associated with breast cancer risk in the homozygous state in prior studies. We evaluated whether the AURKA F31I polymorphism modifies breast cancer risk in BRCA1 and BRCA2 mutation carriers from the Consortium of Investigators of Modifiers of BRCA1/2. Consortium of Investigators of Modifiers of BRCA1/2 was established to provide sufficient statistical power through increased numbers of mutation carriers to identify polymorphisms that act as modifiers of cancer risk and can refine breast cancer risk estimates in BRCA1 and BRCA2 mutation carriers. A total of 4,935 BRCA1 and 2,241 BRCA2 mutation carriers and 11 individuals carrying both BRCA1 and BRCA2 mutations was genotyped for F31I. Overall, homozygosity for the 31I allele was not significantly associated with breast cancer risk in BRCA1 and BRCA2 carriers combined [hazard ratio (HR), 0.91; 95% confidence interval (95% CI), 0.77-1.06]. Similarly, no significant association was seen in BRCA1 (HR, 0.90; 95% CI, 0.75-1.08) or BRCA2 carriers (HR, 0.93; 95% CI, 0.67-1.29) or when assessing the modifying effects of either bilateral prophylactic oophorectomy or menopausal status of BRCA1 and BRCA2 carriers. In summary, the F31I polymorphism in AURKA is not associated with a modified risk of breast cancer in BRCA1 and BRCA2 carriers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,021

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,330
Écart entre enseignants0,307 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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