The Proprotein Convertase SKI-1/S1P
Notice bibliographique
Résumé
Subtilisin kexin isozyme-1 (SKI-1) represents the first mammalian member of secretory subtilisin-like processing enzymes that cleaves after nonbasic residues. It is synthesized as an inactive precursor that undergoes three sequential autocatalytic processing steps of its N-terminal prosegment and an ectodomain shedding at a site near the transmembrane domain. The various cellular functions of SKI-1 emphasize the need to understand the sites of its activation and shedding. We have previously shown that SKI-1 undergoes autocatalytic shedding at the sequence KHQKLL(953) downward arrow, resulting in a membrane-bound stump called St-1 (amino acids 954-1052). However, little is known about the cellular localization of SKI-1 or its shed forms. In the present study, we have further identified a smaller C-terminal fragment St-2 generated closer to the transmembrane domain. By sequencing and mass spectrometric analysis, the start site and the molecular mass of St-2 were determined. Site-directed mutagenesis revealed the critical amino acid involved in this novel process. Mutation of Met(990) to M990A, M990I, and M990L failed to generate St-2, suggesting an internal alternate translation event at Met(990), as confirmed by an in vitro transcription/translation assay. Confocal microscopy defined the subcellular localization of SKI-1 and its fragments. The data show that most of membrane-bound SKI-1 and its stumps St-1 and St-2 localize to the Golgi and can enter the endosomal/lysosomal compartments but do not sort to the cell surface. Deletion studies showed that the transmembrane domain of SKI-1 determines its trafficking. Finally, rSt-1 and rSt-2 seem to affect the processing of ATF6 by SKI-1, but cellular stress does not regulate the production of St-2.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».