ADAR1 Interacts with PKR during Human Immunodeficiency Virus Infection of Lymphocytes and Contributes to Viral Replication
Notice bibliographique
Résumé
The interferon-induced protein kinase RNA activated (PKR) is activated after virus infection. This activation is transient during the human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) infection of lymphocytes, and the protein is not activated at the peak of infection. We observed that interferon-induced adenosine deaminase acting on RNA 1-p150 (ADAR1-p150) and ADAR1-p110 expression increases while the virus replicates actively. Furthermore, both forms of ADAR1 show enhanced interactions with PKR at the peak of HIV infection, suggesting a role for this protein in the regulation of PKR activation. We observed that ADAR1-p150, as previously shown for the TAR RNA binding protein (TRBP), reverses the PKR inhibition of HIV expression and production in HEK 293T cells. This activity requires the Z-DNA binding motif and the three double-stranded RNA binding domains but not the catalytic domain. In astrocytic cells, ADAR1-p150 increased HIV expression and production to an extent similar to that of TRBP. Small interfering RNAs against ADAR1-p150 moderately decreased HIV production. These results indicate that two interferon-induced proteins, ADAR1 and PKR, have antagonistic functions on HIV production. They suggest that ADAR1 and TRBP belong to a multiprotein complex that inhibits PKR during the HIV infection of lymphocytes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».