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Enregistrement W1970623362 · doi:10.1034/j.1399-3054.2003.00041.x

Cold induced expression of plant defensin and lipid transfer protein transcripts in winter wheat

2003· article· en· W1970623362 sur OpenAlexaff
D. A. Gaudet, André Laroche, Michele Frick, René Huel, B. Puchalski

Notice bibliographique

RevuePhysiologia Plantarum · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAntimicrobial Peptides and Activities
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyPlant lipid transfer proteinsComplementary DNASuppression subtractive hybridizationcDNA libraryDefensinMolecular biologySubfamilyGene expressionBotanyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In winter wheat, low temperature hardening induces a non‐specific resistance to snow moulds and other fungi. In a suppressive subtractive hybridization cDNA library between winter wheat unhardened and hardened at 2°C, 17% of 186 sequenced cDNA clones were homologous to the small plant defence related proteins, γ‐thionin, γ‐purothionin or non‐specific lipid transfer proteins (LTPs), based on their nucleotide sequences or deduced from amino acid sequences. Several partial‐ and full‐length cDNA clones homologous to two defensin proteins (γ‐thionin, subfamily B‐2, γ‐purothionin, subfamily I), and non‐specific LTPs were isolated. Regulation of defensin transcripts was clearly different from that of the LTPs under controlled environments in the field. The γ‐thionin and γ‐purothionin transcripts were not expressed in unhardened plants grown at 20°C, strongly upregulated after 1–3 days hardening at 2°C, remained upregulated for 28 days hardening, and disappeared following 1 day of exposure to dehardening conditions at 20°C. The LTPs transcripts were constitutively expressed in plants growing at 20°C, gradually increased to maximum levels following 14–28 days at hardening, and remained upregulated following 1 and 7 days dehardening. In the field, the γ‐thionin and γ‐purothionin transcripts rapidly increased to maximum levels by mid‐November and decreased gradually during the winter until mid‐March LTP transcripts were highly expressed in the early autumn, further increased during December–January, then decreased during late winter and early spring. Differences in the pattern and level of expression of these transcripts were evident among cultivars; γ‐thionin expression was associated with freezing resistance among the genotypes tested under both controlled environment and field conditions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,201
Écart entre enseignants0,185 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations71
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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