Phylogeography, introgression, and population structure of the eastern North American birches Betula alleghaniensis, B. papyrifera, and B. lenta
Notice bibliographique
Résumé
This study examines phylogeography, population genetics, and introgression in birches (Betula spp.) of eastern North America with a specific focus on B. papyrifera Marsh., B. alleghaniensis Britt., and B. lenta L. Betula papyrifera (2n=56, 70, 84)occupies a wide variety of habitats across the transcontinental boreal zone and into northeastern temperate forests. Betula alleghaniensis (2n=84) is a mesophytic species occurring from southeastern Canada and New England to the southern Appalachians. Betula lenta (2n=28) is endemic to the Appalachian region of the United States, where it occurs primarily on moist, cool sites. Phylogeographic analyses based on chloroplast DNA (cpDNA) markers were used for inferring locations of glacial refugia and patterns of post-glacial migration. Nuclear microsatellite markers were used for investigating \nallelic richness, gene diversity, and genetic structure of populations of each species. The haplotype sharing among species was examined to elucidate patterns of cpDNA \nintrogression, and nuclear microsatellite allele sharing was investigated to determine the incidence of nuclear genomic introgression. The cpDNA analyses revealed phylogeographic structuring of eastern and western populations of B. alleghaniensis and B. papyrifera suggesting postglacial colonization from separate refugia. The geographically structured patterns of regional cpDNA haplotype sharing between B. alleghaniensis and B. papyrifera suggest widespread introgression between species during the postglacial recolonization. In contrast, cpDNA markers were monomorphic in B. lenta and no haplotype sharing between B. lenta and other species were detected. Nuclear microsatellite data revealed low levels of population genetic substructure in each of the species with significant differentiation at larger spatial scales due to isolation by \ndistance. The low level of population differentiation over relatively long distances probably reflects the long distance pollen and seed dispersal of these species. The \nanalysis of nuclear microsatellite allele-sharing revealed that despite moderate to high proportions of shared alleles, each of the species was significantly genetically \ndifferentiated. No strong evidence of genetic introgression was found for B. alleghaniensis and B. lenta, or B. papyrifera and B. lenta. Admixture proportions were \nhigher between B. alleghaniensis and B. papyrifera in the western Great Lakes, which is a previously-documented zone of hybridization based on the occurrence of morphological \nintermediates.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».