Genetic population structure across a range of geographic scales in the commercially exploited marine gastropod Buccinum undatum
Notice bibliographique
Résumé
MEPS Marine Ecology Progress Series Contact the journal Facebook Twitter RSS Mailing List Subscribe to our mailing list via Mailchimp HomeLatest VolumeAbout the JournalEditorsTheme Sections MEPS 317:157-169 (2006) - doi:10.3354/meps317157 Genetic population structure across a range of geographic scales in the commercially exploited marine gastropod Buccinum undatum D. Weetman1,*, L. Hauser1,2, M. K. Bayes3, J. R. Ellis4, P. W. Shaw3 1Department of Biological Sciences, University of Hull, Hull HU6 7RX, UK 2School of Aquatic and Fishery Sciences, University of Washington, 1122 NE Boat Street, Box 355020, Seattle, Washington 98195-5020, USA 3School of Biological Sciences, Royal Holloway, University of London, Egham, Surrey TW20 0EX, UK 4Centre for Environmental Fisheries and Aquaculture Sciences, (CEFAS) Lowestoft Laboratory, Lowestoft, Suffolk NR33 0HT, UK *Email: dweetman@hotmail.co.uk ABSTRACT: Marine invertebrates are exploited increasingly as food resources worldwide, but knowledge of genetic population structure is limited for most commercially valuable taxa. We investigated genetic structure in the widely distributed, subtidal gastropod Buccinum undatum by screening samples from 28 locations at 5 microsatellite loci. Multidimensional scaling and cluster analysis were applied to study macrogeographic structure, and revealed 4 well-supported groupings of populations: Canada, Iceland, Swedish Skaggerak, and a cluster containing most samples from the European continental shelf (hereafter 'Shelf'). A fifth cluster comprising all 5 samples from the Solent (UK) relied on exceptional differentiation of just 2 alleles, which is consistent with significant evidence for recent bottlenecks in this area. Within the Shelf cluster most pairwise tests of differentiation were significant, although the global FST of 0.014 was very low for a direct-developing species. Our data suggest that use of highly polymorphic markers caused a relatively minor downward bias to FST, although historical connectivity of populations that are not in migration-drift equilibrium might be more important. However, significant isolation by distance among British North Sea coast samples (FST = 0.010) is consistent with approach to equilibrium and suggests recent gene flow, probably between semi-continuous populations. At a microgeographic scale, we found migration to be consistently higher from inshore to offshore within 3 separate areas; a factor that may underpin the lower diversity and greater differentiation observed for bay and inlet populations. Such populations might serve as important sources of genetic diversity, but are likely to be particularly vulnerable to exploitation. KEY WORDS: Fishery genetics · Whelk · Microsatellites · Isolation by distance · Asymmetric migration · Bottleneck Full text in pdf format PreviousNextExport citation RSS - Facebook - Tweet - linkedIn Cited by Published in MEPS Vol. 317. Online publication date: July 18, 2006 Print ISSN: 0171-8630; Online ISSN: 1616-1599 Copyright © 2006 Inter-Research.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».