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Enregistrement W1971866921 · doi:10.4161/cc.20095

PHF19 and Akt control the switch between proliferative and invasive states in melanoma

2012· article· en· W1971866921 sur OpenAlexaff
Stéphanie Ghislin, Frédérique Deshayes, Sandrine Middendorp, Nicole Boggetto, Catherine Alcaïde‐Loridan

Notice bibliographique

RevueCell Cycle · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensCanadian Nautical Research Society
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyHomeobox protein NANOGProtein kinase BChromatin immunoprecipitationGene silencingCell biologyCancer researchGene expressionMolecular biologyPromoterSignal transductionEmbryonic stem cellGeneticsGeneInduced pluripotent stem cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Melanoma tumor cells shift between proliferative and invasive states based on their plasticity and microenvironmental conditions. Our team has shown that melanoma cells, grown as spheroids in a neural cell crest medium, polarize toward an invasive phenotype, characterized by a higher motility, a poor proliferation rate and a gain of pluripotency gene expression (Nanog and Oct4) when compared with cells grown in two dimensions in a serum-contaning medium. In agreement with the phenotypic switching hypothesis, most of these features are reversible. Microarray studies comparing two- vs. three-dimensional cultures revealed the downregulation of a polycomb-like protein, PHF19 (PHD finger protein 19), in the spheroids. As Polycomb proteins are involved in the epigenetic control of gene expression, we hypothesized that PHF19 might play a role in the switch between proliferative and invasive phenotypes. In this report, we show that PHF19 silencing reduces the cell proliferation rate and increases the transendothelial migration capacities of melanoma cell lines. However, PHF19 does not modulate the transcription level of Oct4 and Nanog. In the search of an upstream transcriptional regulator of the above genes, we identified the Akt signaling cascade as an inhibitor of Oct4 and Nanog expression and an activator for PHF19 expression. Through chromatin immunoprecipitation, we further provide evidence that phospho-Akt is part of the transcriptional complex associated to the promoters of all three genes. Our data therefore indicate the role of PHF19 and its upstream regulator, Akt, in the phenotype switch of melanoma cells from proliferative to invasive states.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations44
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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