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Enregistrement W1971930005 · doi:10.1021/ac202599b

Polymerase Chain Reaction-Free, Sample-to-Answer Bacterial Detection in 30 Minutes with Integrated Cell Lysis

2011· article· en· W1971930005 sur OpenAlexafffund
Brian Lam, Zhichao Fang, Edward H. Sargent, Shana O. Kelley

Notice bibliographique

RevueAnalytical Chemistry · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueBiosensors and Analytical Detection
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésLysisChemistryDetection limitPolymerase chain reactionBacteriaMicrobiological cultureReal-time polymerase chain reactionSample preparationBacterial cell structureChromatographyComputational biologyMicrobiologyNanotechnologyBiologyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

An important goal for improved diagnosis and management of infectious disease is the development of rapid and accurate technologies for the decentralized detection of bacterial pathogens. Most current clinical methods that identify bacterial strains require time-consuming culture of the sample or procedures involving the polymerase chain reaction. Neither of these approaches has enabled testing at the point-of-need because of the requirement for skilled technicians and laboratory facilities. Here, we demonstrate the performance of an effective, integrated platform for the rapid detection of bacteria that combines a universal bacterial lysis approach and a sensitive nanostructured electrochemical biosensor. The lysis is rapid, is effective at releasing intercellular RNA from bacterial samples, and can be performed in a simple, cost-effective device integrated with an analysis chip. The platform was directly challenged with these unpurified lysates in buffer and urine. We successfully detected the presence of bacteria with high sensitivity and specificity and achieved a sample-to-answer turnaround time of 30 min. We have met the clinically relevant detection limit of 1 cfu/μL, indicating that uncultured samples can be analyzed. This advance will greatly reduce time to successful detection from days to minutes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,026
Score d'incertitude au seuil0,971

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,179
Écart entre enseignants0,170 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations63
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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