Genetic diversity and population structure of <i>Valdensinia heterodoxa</i> , a potential biocontrol agent for salal in coastal British Columbia
Notice bibliographique
Résumé
Valdensinia heterodoxa is an ascomycete fungus currently being considered as a potential biocontrol agent against salal (Gaultheria shallon). To assess its effectiveness and risks as a biocontrol agent, we investigated its population structure in three geographically separate populations on Vancouver Island and in coastal mainland, British Columbia. Valdensinia heterodoxa was cultured from infected salal leaves, and single-spore cultures were obtained prior to DNA isolation. Amplified fragment length polymorphisms (AFLPs) were used to generate individual DNA fingerprints for each V. heterodoxa isolate. We found low genetic diversity, with just 30 of the 214 loci being polymorphic. There were many shared haplotypes within each population, and analysis of pairwise kinship coefficients showed that as spatial distance increased, genetic similarity decreased. Analysis of molecular variance among populations revealed significant genetic differentiation, with an F ST of 0.182, suggesting limited gene flow. The findings suggest that with low diversity and high population differentiation, the effectiveness of V. heterodoxa as a biocontrol agent to manage salal in forested areas may be limited to localized salal populations or to use in combination with other control methods.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».