<i>Nicotiana occidentalis</i>: A New Herbaceous Host for <i>Blueberry scorch virus</i>
Notice bibliographique
Résumé
Blueberry scorch virus(BlScV) is a carlavirus that causes a serious disease of blueberries (Vaccinium corymbosum L.) in North America (2). In aphid-transmission studies of BlScV using blueberry as host and test species, we found the rate of transmission to be low, and a lengthy incubation period was required before BlScV could be detected. For sequencing studies, RNA extraction from blueberry using standard methods was unreliable and inefficient. These problems prompted a search for alternate hosts. Of 12 herbaceous hosts screened for BlScV transmission using the blueberry aphid, Ericaphis fimbriata Richards, with mechanical transmission, only Nicotiana occidentalis (Wheeler) became infected. After 3 to 4 weeks, infection of N. occidentalis with BlScV resulted in mild symptoms that included pronounced leaf twisting and swollen leaf veins. Infection with BlScV was confirmed using a double-antibody sandwich enzyme-linked immunosorbent assay (DAS-ELISA) kit (Agdia Inc., Elkhart, IN), polyclonal antibodies to BlScV from the antiserum collection at the Pacific Agri-Food Research Center, Summerland, British Columbia, Canada, and reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR). Forward (5'-NTAAACACTCCCGAATATAC-3') and reverse (5'-CAGATTGCTTATCCGGCTTC-3') primers were designed with the published sequence of BlScV isolate NJ-02 (GenBank Accession No. NC003499). An amplicon of the expected size was generated and sequenced. BLAST analysis indicated that the nucleotide sequence of the amplified fragment was 87% identical to the corresponding sequence in NJ-02 (1). N. occidentalis was readily infected with BlScV following aphid or mechanical inoculations from blueberry. With E. fimbriata as the aphid vector, the transmission rate from blueberry to N. occidentalis was approximately 26%, compared with 70% for mechanical inoculations. Mechanical transfer of BlScV between infected N. occidentalisplants resulted in a 100% transmission rate. Recently, with N. occidentalis, we have completely sequenced two strains of BlScV from British Columbia, Canada and identified several aphid vector species. The identification of N. occidentalis as an herbaceous host of BlScV greatly facilitates future studies on the virus. References: (1) T. D. Cavileer et al. J. Gen. Virol. 75: 711, 1994. (2) R. R. Martin and P. R. Bristow. Phytopathology 78:1636, 1988.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».