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Enregistrement W1972253620 · doi:10.1093/cid/cir228

Single Nucleotide Polymorphisms in the Promoter of the Gene Encoding the Lipopolysaccharide Receptor CD14 Are Associated With Bacterial Diarrhea in US and Canadian Travelers to Mexico

2011· article· en· W1972253620 sur OpenAlexaboutno aff
Mohamed A. Jamal, Herbert L. DuPont, Jose Flores, Himaja Palur, Parvathy Nair, Zhi-Dong Jiang, Dongchuan Guo, Jaime Belkind‐Gerson, Pablo C. Okhuysen

Notice bibliographique

RevueClinical Infectious Diseases · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTravel-related health issues
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCenter for Clinical and Translational Sciences, University of Texas Health Science Center at HoustonNational Institutes of Health
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismCD14DiarrheaLipopolysaccharideMedicineGeneTLR4MicrobiologyImmunologyBiologyGeneticsInflammationGenotypeInternal medicineImmune system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Under normal conditions, the expression of CD14, which is the principal receptor for bacterial lipopolysaccharide, is down-regulated in the intestinal mucosa but increases in response to inflammatory stimuli. The aim of the present study was to investigate whether fecal CD14 levels increased in response to infection with diarrheagenic Escherichia coli and whether single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the CD14 gene were associated with an increased susceptibility to traveler's diarrhea (TD) in US visitors to Mexico. METHODS: Six SNPs located at the promoter, exon, and untranslated regions of CD14 were typed in a prospective cohort study of 1360 visitors to Mexico at risk for TD. Stools from visitors with TD were studied for enteric pathogens by culture, colony hybridization, and polymerase chain reaction. Fecal soluble CD14 (sCD14) was measured in a subgroup of 203 adults with diarrhea and 66 healthy controls by enzyme-linked immunosorbent assay. RESULTS: The minor allele frequencies for CD14 SNPs were significantly different among the various racial and ethnic groups studied. Two SNPs in the promoter region of CD14 (-159 C > T; rs2569190 and -4191 C > T; rs5744441) were found to be associated with TD in White visitors. The -159 TT genotype was associated with a higher risk for TD (Relative risk [RR], 1.21; 95% confidence interval [CI], 1.05-1.38; P = .008), whereas individuals with the -4191 TT genotype were protected from infection (RR, 0.82; 95% CI, 0.71-0.92; P = .006). Subjects with TD excreted higher levels of fecal CD14 than did healthy controls (33,480 pg/mL vs 6178 pg/mL; P < .02). Fecal sCD14 levels were higher in stool samples from visitors with TD and the -159 TT genotype than they were in visitors with the CC/CT genotypes (P = .02), and stool samples from subjects with the -4191 CC genotype had higher fecal sCD14 levels than did stool samples from visitors with the CT/TT (P = .005) genotype. In a multivariate analysis with haplotypes constructed with the 6 SNPs studied, subjects with the haplotype containing the -159 C and the -4191 T allele were less likely to acquire TD (P = .015). CONCLUSIONS: Our study suggests that CD14 levels increase in response to bacterial diarrhea and that polymorphisms in the CD14 gene influence susceptibility to TD. Intestinal CD14 plays an important role in the innate immune response to enteric pathogens.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,220
Score d'incertitude au seuil0,963

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,052
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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