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Enregistrement W1972395484 · doi:10.1128/jcm.01255-07

<i>Salmonella enterica</i> Serovar Senftenberg Human Clinical Isolates Lacking SPI-1

2008· article· en· W1972395484 sur OpenAlexaff
Qinghua Hu, Bryan Coburn, Wanyin Deng, Yuling Li, Xiaolu Shi, Quanxue Lan, Bing Wang, Brian K. Coombes, B. Brett Finlay

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Microbiology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSalmonella and Campylobacter epidemiology
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of ChinaHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésSalmonella entericaBiologySerotypeMicrobiologyVirulenceSalmonellaMultilocus sequence typingPathogenicity islandVirologyEnteritisBacteriaGeneGenotypeGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Nontyphoidal Salmonella species cause gastrointestinal disease worldwide. The prevailing theory of Salmonella enteropathogenesis is that bacterial invasion of the intestinal epithelium is essential for virulence and that this requires the virulence-associated genomic region Salmonella pathogenicity island 1 (SPI-1). Recent studies of Salmonella enterica infection models have demonstrated that enterocolitis and diarrhea in mice and cows can occur independently of SPI-1. In this study, we sought to confirm whether two S. enterica serovar Senftenberg clinical isolates lacked genes essential for SPI-1 function. Two clinical strains were isolated and identified as being S. enterica serovar Senftenberg from four stool samples from a food-borne disease outbreak affecting seven individuals in Shenzhen, Guangdong Province, China, using conventional methods, pulsed-field gel electrophoresis and multilocus sequence typing. The possibility of coinfection with other potential bacteria or usual viruses was excluded. Two isolates were analyzed for the presence of invA, sipA, ssaR, sifA, and sopE2 by PCR and Southern blotting and were then assayed for the presence of SPI-1 by PCR and long-range PCR for fhlA-hilA, hilA-spaP, and spaP-invH and Southern blot analysis. A long-range PCR fragment from fhlA to mutS covering the 5' and 3' flanks of SPI-1 was also amplified from the two clinical isolates and sequenced. In addition, the two clinical isolates were assayed for enteroinvasiveness in vitro. Murine infection models were also examined. Biochemical tests and serotyping confirmed that the two clinical isolates are S. enterica serovar Senftenberg. However, they lacked genes critical for SPI-1 function but contained SPI-2 genes and were attenuated for the invasion of cultured intestinal epithelial cells. In conclusion, clinical S. enterica serovar Senftenberg strains isolated from a food-borne disease outbreak lack the invasion-associated locus SPI-1, indicating that SPI-1 is not essential for human gastroenteritis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,289
Score d'incertitude au seuil0,608

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,142
Tête enseignante GPT0,378
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations85
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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