MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1972599183 · doi:10.1371/journal.pgen.1000067

A Genetic Screen for Dihydropyridine (DHP)-Resistant Worms Reveals New Residues Required for DHP-Blockage of Mammalian Calcium Channels

2008· article· en· W1972599183 sur OpenAlexafffund
Trevor C. Y. Kwok, Kwokyin Hui, Wojciech Kostelecki, Nicole Ricker, Guillermo Selman, Zhong‐Ping Feng, Peter J. Roy

Notice bibliographique

RevuePLoS Genetics · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthNational Center for Research ResourcesHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésBiologyDepolarizationVoltage-dependent calcium channelMutantCalcium channelCaenorhabditis elegansMissense mutationIon channelMutationProtein subunitDihydropyridineBiophysicsN-type calcium channelCalciumGeneticsBiochemistryT-type calcium channelGeneChemistryReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Dihydropyridines (DHPs) are L-type calcium channel (Ca(v)1) blockers prescribed to treat several diseases including hypertension. Ca(v)1 channels normally exist in three states: a resting closed state, an open state that is triggered by membrane depolarization, followed by a non-conducting inactivated state that is triggered by the influx of calcium ions, and a rapid change in voltage. DHP binding is thought to alter the conformation of the channel, possibly by engaging a mechanism similar to voltage dependent inactivation, and locking a calcium ion in the pore, thereby blocking channel conductance. As a Ca(v)1 channel crystal structure is lacking, the current model of DHP action has largely been achieved by investigating the role of candidate Ca(v)1 residues in mediating DHP-sensitivity. To better understand DHP-block and identify additional Ca(v)1 residues important for DHP-sensitivity, we screened 440,000 randomly mutated Caenorhabditis elegans genomes for worms resistant to DHP-induced growth defects. We identified 30 missense mutations in the worm Ca(v)1 pore-forming (alpha(1)) subunit, including eleven in conserved residues known to be necessary for DHP-binding. The remaining polymorphisms are in eight conserved residues not previously associated with DHP-sensitivity. Intriguingly, all of the worm mutants that we analyzed phenotypically exhibited increased channel activity. We also created orthologous mutations in the rat alpha(1C) subunit and examined the DHP-block of current through the mutant channels in culture. Six of the seven mutant channels examined either decreased the DHP-sensitivity of the channel and/or exhibited significant residual current at DHP concentrations sufficient to block wild-type channels. Our results further support the idea that DHP-block is intimately associated with voltage dependent inactivation and underscores the utility of C. elegans as a screening tool to identify residues important for DHP interaction with mammalian Ca(v)1 channels.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,044
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,054
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePLoS GeneticsMême sujetIon channel regulation and functionTravaux en français237 207