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Enregistrement W1973068597 · doi:10.1074/jbc.m113.465633

Individual Interactions of the b Subunits within the Stator of the Escherichia coli ATP Synthase*

2013· article· en· W1973068597 sur OpenAlexafffund
Karsten Brandt, Sarah Maiwald, Brigitte Herkenhoff-Hesselmann, Kerstin Gnirß, Jörg‐Christian Greie, Stanley D. Dunn, Gabriele Deckers‐Hebestreit

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueATP Synthase and ATPases Research
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésProtein subunitATP synthase gamma subunitATP synthaseSpecificity factorChemistryCysteineEscherichia coliATP hydrolysisBiochemistryStereochemistryBiophysicsBiologyATPaseEnzymeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

F O F 1 ATP synthases are rotary nanomotors that couple proton translocation across biological membranes to the synthesis/hydrolysis of ATP. During catalysis, the peripheral stalk, composed of two b subunits and subunit δ in Escherichia coli , counteracts the torque generated by the rotation of the central stalk. Here we characterize individual interactions of the b subunits within the stator by use of monoclonal antibodies and nearest neighbor analyses via intersubunit disulfide bond formation. Antibody binding studies revealed that the C-terminal region of one of the two b subunits is principally involved in the binding of subunit δ, whereas the other one is accessible to antibody binding without impact on the function of F O F 1 . Individually substituted cysteine pairs suitable for disulfide cross-linking between the b subunits and the other stator subunits ( b -α, b -β, b -δ, and b-a ) were screened and combined with each other to discriminate between the two b subunits ( i.e. b I and b II ). The results show the b dimer to be located at a non-catalytic α/β cleft, with b I close to subunit α, whereas b II is proximal to subunit β. Furthermore, b I can be linked to subunit δ as well as to subunit a . Among the subcomplexes formed were a-b I -α, b II -β, α- b I - b II -β, and a-b I -δ. Taken together, the data obtained define the different positions of the two b subunits at a non-catalytic interface and imply that each b subunit has a different role in generating stability within the stator. We suggest that b I is functionally related to the single b subunit present in mitochondrial ATP synthase. Background: The peripheral stator stalk of Escherichia coli ATP synthase contains two b subunits. Results: Using disulfide bond formation, one b subunit was cross-linked to a , α, and δ and the other to β. Conclusion: The b subunits adopt distinct positions within the stator to generate stability. Significance: The different positions imply different roles in counteracting the torque generated by the rotor.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,225

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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