Rapid human immunodeficiency virus disease progression is associated with human leukocyte antigen-B homozygocity and human leukocyte antigen-B51 in a cohort from Manitoba, Canada
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) infection is associated with variable rates of disease progression, influenced by the quality of CD8 T-lymphocyte response, which is determined by human leukocyte antigen (HLA) I alleles. Some individuals progress slowly and maintain viral control, while at the opposite end of the spectrum some individuals endure a faster progression with rapid CD4 decline. We sought to determine the role of HLA-B allele frequency on rapid HIV disease progression. It was hypothesized that rapid progression is associated with the presence of high allele frequency of HLA-B35 and HLA-B homozygocity. METHODS: This retrospective cohort study was conducted in the Manitoba HIV Program, Health Sciences Centre, a tertiary care facility in Winnipeg, Manitoba, Canada. We defined a set of new criteria to describe a subset of individuals with the most rapid HIV disease progression, and collected demographic, clinical, laboratory (CD4 count, viral load) and HLA data on a subset of 20 individuals meeting these criteria. RESULTS: Among those individuals who display extreme rapid progression, an overrepresentation of Aboriginal ethnicities, high frequencies of HLA-B35 and significantly higher rates of HLA-B51, as well as a very high rate of homozygocity for HLA-B alleles, were observed. CONCLUSIONS: Individuals with the most rapid disease progression have higher rates of HLA-B homozygocity, HLA-B51 alleles and higher viral loads than those with normal progression rates. This group, at the extreme end of the spectrum of progression, should be targeted for early treatment.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,005 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».