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Enregistrement W1973252533 · doi:10.1021/bi901742g

A Comparative Study on Conformation and Ligand Binding of the Neuronal Uncoupling Proteins

2009· article· en· W1973252533 sur OpenAlexaff
М. В. Иванова, Tuan Hoang, Fern R. McSorley, Gabriela Krnac, Matthew D. Smith, Masoud Jelokhani‐Niaraki

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdipose Tissue and Metabolism
Établissements canadiensWilfrid Laurier University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGTP'NucleotideVesicleChemistryBiophysicsFluorescenceBinding siteLiposomeBiochemistryStereochemistryBiologyMembrane

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mitochondrial uncoupling proteins of the nervous system (UCPs 2, 4, and 5) have potential roles in the function and protection of the central nervous system (CNS). In the absence of structural information, conformations of the hexahistidine-tagged versions of all five human UCPs in liposomes were investigated for the first time, using far- and near-UV CD and fluorescence spectroscopy. Highly pure UCPs 1-5 were reconstituted in detergents and stable small unilamellar vesicles, appropriate for spectroscopic studies. All UCPs formed dominantly helical conformations in negatively charged phospholipid vesicles (palmitoyloleoylphosphatidylcholine/palmitoyloleoylphosphatidylglycerol, 7:3 molar ratio). UCPs 2 and 5 exhibited comparable helical conformations with possible association in lipid bilayers, whereas UCP4 had a different helical profile that can be related to its less associated form. Interaction of reconstituted UCPs with GDP and GTP, inhibitors of the prototypic UCP1, was detected by near-UV CD and fluorescence spectroscopy, utilizing the sensitivity of these techniques to microenvironments around Trp residues close to the nucleotide binding site. Binding of UCP4 to purine nucleotides was also different from other UCPs. Binding of fatty acids, activators of proton transport in UCPs, to UCPs could not be unambiguously detected, implying a nonbinding conformation/orientation of the proteoliposomes. Interaction of CoA with UCPs was comparable to nucleotide binding, suggesting a possible binding of this molecule at the nucleotide binding site. Despite dissimilar primary sequences, neuronal UCPs share common structural and functional properties with UCPs 1 and 3, supporting a common physiological role in addition to their specific roles in the CNS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,078
Score d'incertitude au seuil0,163

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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