MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1974203897 · doi:10.1074/jbc.m403954200

A Conserved DpYR Motif in the Juxtamembrane Domain of the Met Receptor Family Forms an Atypical c-Cbl/Cbl-b Tyrosine Kinase Binding Domain Binding Site Required for Suppression of Oncogenic Activation

2004· article· en· W1974203897 sur OpenAlexaff
Pascal Peschard, Noboru Ishiyama, Lin Tong, Stan Lipkowitz, Morag Park

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueAxon Guidance and Neuronal Signaling
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryTyrosine kinaseCancer researchBinding siteTyrosineReceptor tyrosine kinaseCooperative bindingMolecular biologyCell biologyReceptorBiologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The activation and phosphorylation of Met, the receptor tyrosine kinase (RTK) for hepatocyte growth factor, initiates the recruitment of multiple signaling proteins, one of which is c-Cbl, a ubiquitin-protein ligase. c-Cbl promotes ubiquitination and enhances the down-modulation of the Met receptor and other RTKs, targeting them for lysosomal sorting and subsequent degradation. The ubiquitination of Met by c-Cbl requires the direct interaction of the c-Cbl tyrosine kinase binding (TKB) domain with tyrosine 1003 in the Met juxtamembrane domain. Although a consensus for c-Cbl TKB domain binding has been established ((D/N)XpYXX(D/E0phi), this motif is not present in Met, suggesting that other c-Cbl TKB domain binding motifs may exist. By alanine-scanning mutagenesis, we have identified a DpYR motif including Tyr(1003) as being important for the direct recruitment of the c-Cbl TKB domain and for ubiquitination of the Met receptor. The substitution of Tyr(1003) with phenylalanine or substitution of either aspartate or arginine residues with alanine impairs c-Cbl-recruitment and ubiquitination of Met and results in the oncogenic activation of the Met receptor. We demonstrate that the TKB domain of Cbl-b, but not Cbl-3, binds to the Met receptor and requires an intact DpYR motif. Modeling studies suggest the presence of a salt bridge between the aspartate and arginine residues that would position pTyr(1003) for binding to the c-Cbl TKB domain. The DpYR motif is conserved in other members of the Met RTK family but is not present in previously identified c-Cbl-binding proteins, identifying DpYR as a new binding motif for c-Cbl and Cbl-b.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,397

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,068
Tête enseignante GPT0,298
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations119
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Biological ChemistryMême sujetAxon Guidance and Neuronal SignalingTravaux en français237 207