Structural diversity of the core oligosaccharide domain of Pseudomonas aeruginosa lipopolysaccharide
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Notice bibliographique
Résumé
Pseudomonas aeruginosa is a Gram-negative bacterium that is ubiquitous in the environment and generally considered to be a saprophyte, but it is also an important opportunistic human pathogen. Pseudomonas aeruginosa elaborates a variety of virulence factors, one of which is lipopolysaccharide (LPS). LPS of P. aeruginosa is composed of three distinct regions: lipid A, core oligosaccharide (OS), and the long-chain O antigen. The core OS of P. aeruginosa is composed of L-glycero-D-manno-heptose, 3-deoxy-D-manno-oct-2-ulosonic acid, D-galactosamine, D-glucose, and L-rhamnose. Non-carbohydrate substituents are also found in the core OS including phosphate, 2-aminoethyl (di)phosphate, acetyl, alanyl and carbamoyl groups. Pseudomonas aeruginosa simultaneously synthesizes two core glycoforms, namely, capped and uncapped core. The capped core is covalently attached to an O antigen, whereas the uncapped core is devoid of O antigen. Although the core of P. aeruginosa LPS is relatively conserved, strain-to-strain variability of its structure exists. This includes phosphorylation pattern, the level of O-acetylation, and the presence or absence of a fourth glucose residue at the distal end of the uncapped core. A number of studies have been reported on the structures of unique truncated core OS with unusual modifications. This mini-review summarizes the diversity of P. aeruginosa complete and truncated core OS structures published over the past fifteen years.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,003 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle