Improved HIV-1 incidence estimates using the BED capture enzyme immunoassay
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: To validate the BED capture enzyme immunoassay for HIV-1 subtype C and to derive adjustments facilitating estimation of HIV-1 incidence from cross-sectional surveys. DESIGN: Laboratory analysis of archived plasma samples collected in Zimbabwe. METHODS: Serial plasma samples from 85 women who seroconverted to HIV-1 during the postpartum year were assayed by BED and used to estimate the window period between seroconversion and the attainment of a specified BED absorbance. HIV-1 incidences for the year prior to recruitment and for the postpartum year were calculated by applying the BED technique to HIV-1-positive samples collected at baseline and at 12 months. RESULTS: The mean window for an absorbance cut-off of 0.8 was 187 days. Among women who were HIV-1 positive at baseline and retested at 12 months, a proportion (epsilon) 5.2% (142/2749) had a BED absorbance < 0.8 at 12 months and were falsely identified as recent seroconverters. Consequently, the estimated BED annual incidence at 12 months postpartum (7.6%) was 2.2 times the contemporary prospective estimate. BED incidence adjusted for epsilon was 3.5% [95% confidence interval (CI), 2.6-4.5], close to the 3.4% estimated prospectively. Adjusted BED incidence at baseline was 6.0% (95% CI, 5.2-6.9) and, like the prospective estimates, declined with maternal age. Unadjusted BED incidence estimates were largely independent of age; the pooled estimate was 58% higher than adjusted incidence. CONCLUSION: The BED method can be used in an African setting, but further estimates of epsilon and of the window period are required, using large samples in a variety of circumstances, before its general utility can be gauged.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,006 | 0,015 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».