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Enregistrement W1975129784 · doi:10.1139/b05-064

Growth, photosynthesis, and gene expression in <i>Chlamydomonas</i> over a range of CO<sub>2</sub> concentrations and CO<sub>2</sub>/O<sub>2</sub> ratios: CO<sub>2</sub> regulates multiple acclimation states

2005· article· en· W1975129784 sur OpenAlexvenueno aff
Peter Vance, Martin H. Spalding

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Botany · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineEnergy
ThématiqueAlgal biology and biofuel production
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChlamydomonas reinhardtiiPhotosynthesisPhotorespirationCarbonic anhydraseBiologyRuBisCOBiochemistryGene expressionChlamydomonasPeriplasmic spaceGeneBotanyChemistryMutantEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Growth, photosynthesis, and induction of two low CO 2 -inducible genes of Chlamydomonas reinhardtii Dangeard strain CC125 were quantified in a range of physiologically relevant CO 2 and O 2 concentrations (5%–0.005% CO 2 and 20% or 2% O 2 ) using airlift bioreactors to facilitate the simultaneous measurement of both growth and in situ photosynthetic rates. Within these CO 2 concentration ranges, O 2 concentrations (20% vs. 2%) had no discernable effect on growth, photosynthetic rate, or induction of the periplasmic carbonic anhydrase (Cah1) and glycolate dehydrogenase (Gdh) genes in wild-type C. reinhardtii. These results failed to support the hypothesis that the CO 2 /O 2 ratio plays any role in signaling for the up-regulation of limiting CO 2 -induced genes and (or) of the CO 2 -concentrating mechanism (CCM). The mRNA abundance of the Cah1 and Gdh genes appeared to be regulated in concert, suggesting co-regulation by the same signaling pathway, which, because of a lack of an O 2 effect, seems unlikely to involve photorespiration or a photorespiratory metabolite. Instead, it appeared that the CO 2 concentration alone was responsible for regulation of limiting CO 2 acclimation responses. Based on growth, photosynthesis, and gene expression characteristics, three distinct CO 2 -regulated physiological states were recognized within the studied parameters, a high CO 2 (5%–0.5%) state, a low CO 2 (0.4%–0.03%) state, and a very low CO 2 (0.01%–0.005%) state. Induction of Cah1 expression and Gdh up-regulation occurred at a CO 2 concentration between 0.5% and 0.4% CO 2 , delineating the high from the low CO 2 states. Photosynthetic characteristics also were distinct in the three CO 2 -regulated physiological states, e.g., the estimated K 0.5 (CO 2 ) of the high CO 2 , low CO 2 , and very low CO 2 states were 72, 10, and 0.9 µmol·L –1 CO 2 , respectively. In addition to a greater photosynthetic CO 2 affinity, the very low CO 2 state could be distinguished from the low CO 2 state by an increased cell-doubling time and a smaller cell size.Key words: algae, Chlamydomonas, CO 2 , gene expression, induction, photorespiration, photosynthesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,034
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,002
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations106
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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