Plant Protein Proteinase Inhibitors: Structure and Mechanism of Inhibition
Notice bibliographique
Résumé
This review outlines known examples of the three-dimensional structures of protein proteinase inhibitors from plants. Three families of enzymes, serine proteinases, carboxypeptidases and cysteine proteinases, are targeted by at least a dozen inhibitor families, with the majority of them adopting the standard mechanism of inhibition towards the serine proteinases. All of the inhibitors discussed maintain compact and stable inhibitory domains that bind to the active site of their target proteinases and prevent access to the substrate molecules. One interesting highlight is the knottin group. Three separate inhibitor families utilize the overall knottin fold in a different way. This fold can accommodate extensive sequence variation and for each of the squash, Mirabilis and Potato carboxypeptidase families, the proteinase-binding residues are found at a different location. Plants have also evolved additional strategies to regulate proteinase activity, such as linking inhibitory domains and targeting multiple enzymes at once. The structural aspects of these strategies are discussed in the review. Keywords: Plant protein proteinase inhibitor, three-dimensional structure, reactive-site loop, standard mechanism, Inhibition mechanism, plant protease inhibitors, serine proteinases, carboxypeptidases, inhibitor families, cysteine proteinases, inhibitory domains, Mirabilis, knottin group, suppositions, tissue, NMR methods, X-ray
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».