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Enregistrement W1975382383 · doi:10.1158/1538-7445.am10-1576

Abstract 1576: Molecular targeting of histone deacetylase 2 for treatment of human hepatocellular carcinoma

2010· article· en· W1975382383 sur OpenAlexaff
Yun‐Han Lee, Jesper B. Andersen, Adam D. Judge, Daekwan Seo, Jens U. Marquardt, Tsuyoshi Ishikawa, Itzhak Avital, Elizabeth A. Conner, Ian MacLachlan, Valentina M. Factor, Snorri S. Thorgeirsson

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHistone Deacetylase Inhibitors Research
Établissements canadiensArbutus Biopharma (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHistone deacetylase 2Gene silencingCancer researchBiologyHistone deacetylaseCell growthMolecular biologyCell cultureGene expressionSmall interfering RNAChemistryHistoneTransfectionGeneBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Development of targeted therapeutics for hepatocellular carcinoma (HCC) remains a major challenge. We have recently identified an elevated expression of histone deacetylase 2 (HDAC2) in primary human hepatocellular carcinoma (HCC) and HCC derived cell lines. In this study, we have tested if the downregulation of HDAC2 by siRNA can affect the course of HCC progression in vitro and in vivo. To inactivate HDAC2 gene expression, three HDAC2-specific siRNAs (HDAC2-1, HDAC2-2 and HDAC2-3) were designed and tested for growth inhibition in Huh7 and HepG2 HCC cell lines as determined by MTT assay, FACS analysis and microscopy. To obtain insights into molecular changes caused by HDAC2 silencing, global changes in gene expression were examined by illumina microarray. For in vivo evaluation of HDAC2 as a therapeutic target, we employed orthotopic xenograft model using luciferase-expressing HCC reporter cell line Huh7-luc+ and stable-nucleic-acid-lipid-particle (SNALP) as an optimal carrier of siRNA into liver. The HDAC2-1siRNA was the most effective in inhibiting Huh7 and HepG2 cell growth (68% and 71%, respectively) which was paralleled by a similar decrease in the levels of target mRNA and protein. HDAC2-deficient cells also exhibited a 1.9-fold increase in apoptosis through activation of caspase-3. The comparison of gene expression profiles in HepG2 cells treated with either control siRNA or HDAC2-1siRNA identified 299 differentially expressed genes. Consistent with in vitro observations, genes functionally involved in apoptosis, such as CDKN1A, SOCS2, TP53I3, and BTG2, were up-regulated while genes associated with cellular metabolic process (e.g. HOXD1, PAK2, SMAD9, CDK4, PCK2 and SKP2) were down-regulated. HDAC2 3/7siRNA, a chemically modified variant of HDAC2-1siRNA displaying a minimal induction of IL-6 in murine Flt3L dendricite cultures, was selected for in vivo treatment of Huh7-luc+-derived HCC. Administration of SNALP- HDAC2 3/7siRNA effectively suppressed xenograft growth as compared to the SNALP-control siRNA treatment. Taken together, these results indicate that HDAC2 is an important regulator of HCC cell growth and survival, and may be an attractive target for systemic therapy of HCC. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 101st Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2010 Apr 17-21; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2010;70(8 Suppl):Abstract nr 1576.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,417
Écart entre enseignants0,370 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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