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Enregistrement W1975658035 · doi:10.1080/01694243.2012.693830

Study on the role of polyethylenimine as gene delivery carrier using molecular dynamics simulations

2012· article· en· W1975658035 sur OpenAlexafffund
Chongbo Sun, Tian Tang

Notice bibliographique

RevueJournal of Adhesion Science and Technology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Interference and Gene Delivery
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesWestern Canada Research Grid
Mots-clésPolyethylenimineNucleic acidGene deliveryMolecular dynamicsMoleculePolymerNanotechnologyMaterials scienceDNACombinatorial chemistryBiophysicsChemistryGenetic enhancementComputational chemistryOrganic chemistryTransfectionGeneBiochemistryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Polyethylenimine (PEI) is known to be one of the most promising polymers to serve as a delivery carrier in gene therapy. Complexation between PEI molecules and nucleic acids results in nanoparticles that can subsequently enter cells for therapeutic treatment. Design of the carrier molecules for stabler complexation, better cell uptake, and lower cytotoxicity remains to be a challenge. Molecular dynamics (MD) simulations allow atomistic level examination of the complexation between PEI and nucleic acids, as well as the interaction of the complexes formed with other entities in the delivery path. It is a powerful tool in revealing the role of carrier molecules and guiding the design of more effective delivery systems. In this work, we first review the current status in studying complexation of PEI with nucleic acids and interaction between the complex formed and cell membrane. We have conducted preliminary MD simulations on several aspects of complexation between PEI and DNA. These results are presented to demonstrate how MD simulations can help understand the role of PEI in serving as a gene delivery carrier.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,024

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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