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Enregistrement W1976402706 · doi:10.1021/bi900159d

The Stem Cell Marker CD133 (Prominin-1) is Phosphorylated on Cytoplasmic Tyrosine-828 and Tyrosine-852 by Src and Fyn Tyrosine Kinases

2009· article· en· W1976402706 sur OpenAlexaff
Dominique Boivin, David P. Labbé, Nicolas Fontaine, Sylvie Lamy, Édith Beaulieu, Denis Gingras, Richard Béliveau

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Cells and Metastasis
Établissements canadiensUniversité de MontréalUniversité du Québec à Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSH2 domainTyrosine phosphorylationProto-oncogene tyrosine-protein kinase SrcTyrosineFYNReceptor tyrosine kinasePhosphorylationBiologyTyrosine kinaseCell biologyPTK2Platelet-derived growth factor receptorMolecular biologyChemistryBiochemistrySignal transductionProtein kinase A

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

CD133 (prominin-1) is a transmembrane glycoprotein expressed at the surface of normal and cancer stem cells, progenitor cells, rod photoreceptor cells, and a variety of epithelial cells. Although CD133 is widely used as a marker of various somatic and putative cancer stem cells, its contribution to fundamental properties of stem cells such as self-renewal and differentiation remains unknown. CD133 contains a short C-terminal cytoplasmic domain with five tyrosine residues, including a consensus tyrosine phosphorylation site that has not yet been investigated. In this study, we show that CD133 is phosphorylated in human medulloblastoma D283 and Daoy cells, in a Src family kinase-dependent manner. The cytoplasmic domain of CD133 is tyrosine phosphorylated in Daoy cells overexpressing Src and Fyn tyrosine kinases, as well as in vitro using recombinant proteins. Deletion of the C-terminal cytoplasmic domain of CD133 considerably reduced its phosphorylation by Src. To identify the tyrosine phosphorylation sites in CD133, we used matrix-assisted laser desorption/ionization quadrupole time-of-flight (MALDI Q-TOF) and liquid chromatography tandem mass spectrometry (LC-MS/MS). Analysis of tyrosine-phosphorylated CD133 by mass spectrometry and site-directed mutagenesis identified tyrosine-828 and the nonconsensus tyrosine-852 as the major tyrosine phosphorylation sites both in vitro and in intact cells. Identification of CD133 as a substrate for Src-family tyrosine kinases suggests that the cytoplasmic domain of CD133 might play an important role in the regulation of its functions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations86
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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