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Enregistrement W1976594740 · doi:10.1034/j.1399-3054.2000.108001101.x

Molecular cloning and characterization of a type III glutathione <i>S</i>‐transferase from cell suspension cultures of opium poppy treated with a fungal elicitor

2000· article· en· W1976594740 sur OpenAlexafffund
Min Yu, Peter J. Facchini

Notice bibliographique

RevuePhysiologia Plantarum · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlutathione Transferases and Polymorphisms
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésPapaverComplementary DNABiochemistrycDNA libraryBiologyGlutathione S-transferaseMolecular biologyMolecular cloningOpium PoppySouthern blotCatharanthus roseusPapaveraceaeGlutathioneGeneEnzymeAlkaloidBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Glutathione S ‐transferases (GSTs) catalyze the conjugation of electrophilic compounds to glutathione (GSH), and are involved in the detoxification of xenobiotics in plants. However, little is known about the endogenous substrates of plant GSTs, or their role in normal cellular processes. A cDNA library was constructed with poly(A) + RNA isolated from cell suspension cultures of opium poppy ( Papaver somniferum L.) treated with a fungal elicitor. A putative type III GST fragment was amplified by PCR from the cDNA library using degenerate primers designed from conserved domains found in several plant GSTs. The cDNA library was screened with the PCR product and 3 homologous clones were isolated. Deduced amino acid sequences from these clones displayed extensive homology to other plant type III GSTs, especially within the N‐terminal domain. One full‐length cDNA, designated pGST2, was expressed in Escherichia coli , and the recombinant enzyme exhibited strong GST activity in bacterial protein extracts, using 1‐chloro‐2,4‐dinitrobenzene as the substrate. Recombinant GST2 activity was inhibited by p ‐coumaroyl‐ and feruloyl‐CoA esters, and p ‐coumaric‐ and ferulic‐acid amides of tyramine, but not by free hydroxycinnamic acids or aromatic amines. Although type III GSTs in opium poppy appear to bind select endogenous phenolics, the in vitro conjugation of GSH to these compounds was not detected. Genomic DNA gel blot‐hybridization analysis confirmed the existence of a small family of type III GST genes in opium poppy. RNA gel blot‐hybridization analysis showed that type III GST transcripts were most abundant in the roots of mature opium poppy plants, and were induced in developing seedlings and in cell suspension cultures treated with a fungal elicitor. Relative transcript levels were generally consistent with the levels of total GST enzyme activity in each tissue.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,619

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,197
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2000
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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