Regulation of thrombospondin-1 expression through AU-rich elements in the 3′UTR of the mRNA
Notice bibliographique
Résumé
Thrombospondin-1 (TSP-1) is a matricellular protein that participates in numerous normal and pathological tissue processes and is rapidly modulated by different stimuli. The presence of 8 highly-conserved AU rich elements (AREs) within the 3'-untranslated region (3'UTR) of the TSP-1 mRNA suggests that post-transcriptional regulation is likely to represent one mechanism by which TSP-1 gene expression is regulated. We investigated the roles of these AREs, and proteins which bind to them, in the control of TSP-1 mRNA stability. The endogenous TSP-1 mRNA half-life is approximately 2.0 hours in HEK293 cells. Luciferase reporter mRNAs containing the TSP-1 3'UTR show a similar rate of decay, suggesting that the 3'UTR influences the decay rate. Site-directed mutagenesis of individual and adjacent AREs prolonged reporter mRNA halflife to between 2.2 and 4.4 hours. Mutation of all AREs increased mRNA half life to 8.8 hours, suggesting that all AREs have some effect, but that specific AREs may have key roles in stability regulation. A labeled RNA oligonucleotide derived from the most influential ARE was utilized to purify TSP-1 ARE-binding proteins. The AU-binding protein AUF1 was shown to associate with this motif. These studies reveal that AREs in the 3'UTR control TSP-1 mRNA stability and that the RNA binding protein AUF1 participates in this control. These studies suggest that ARE-dependent control of TSP-1 mRNA stability may represent an important component in the control of TSP-1 gene expression.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».