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Enregistrement W1977033276 · doi:10.1139/o08-124

Kinetics of human peptidylarginine deiminase 2 (hPAD2) — Reduction of Ca<sup>2+</sup> dependence by phospholipids and assessment of proposed inhibition by paclitaxel side chains

2008· article· en· W1977033276 sur OpenAlexafffundvenue
Abdiwahab A. Musse, Eugenia Polverini, Reinout Raijmakers, George Harauz

Notice bibliographique

RevueBiochemistry and Cell Biology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
Thématiqueinterferon and immune responses
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésChemistryBiochemistryEnzymePhosphatidylserinePhosphatidylcholineCitrullinationIn vitroMyelinActive siteEnzyme kineticsArginineStereochemistryPhospholipidBiologyCentral nervous systemAmino acid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Multiple sclerosis is a complex human neurodegenerative disease, characterized by the active destruction of the insulating myelin sheath around the axons in the central nervous system. The physical deterioration of myelin is mediated by hyperdeimination of myelin basic and other proteins, catalysed by the Ca2+ -dependent enzyme peptidylarginine deiminase 2 (PAD2). Thus, inhibition of PAD2 may be of value in treatment of this disease. Here, we have first characterized the in vitro kinetic properties of the human peptidylarginine deiminase isoform 2 (hPAD2). Phosphatidylserine and phosphatidylcholine reduced its Ca2+ dependence by almost twofold. Second, we have explored the putative inhibitory action of the methyl ester side chain of paclitaxel (TSME), which shares structural features with a synthetic PAD substrate, viz., the benzoyl-L-arginine ethyl ester (BAEE). Using the known crystallographic structure of the homologous enzyme hPAD4 and in silico molecular docking, we have shown that TSME interacted strongly with the catalytic site, albeit with a 100-fold lower affinity than BAEE. Despite paclitaxel having previously been shown to inhibit hPAD2 in vitro, the side chain of paclitaxel alone did not inhibit this enzyme's activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,676

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2008
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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