MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1977441177 · doi:10.1210/jc.2013-1834

Decreased Transcriptional Activity of<i>Calcium-sensing receptor</i>Gene Promoter 1 Is Associated With Calcium Nephrolithiasis

2013· article· en· W1977441177 sur OpenAlexaff
Giuseppe Vezzoli, Annalisa Terranegra, A. Aloia, Teresa Arcidiacono, Luciano Milanesi, Ettore Mosca, Alessandra Mingione, Donatella Spotti, Daniele Cusi, Jianghui Hou, Geoffrey N. Hendy, Laura Soldati

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Clinical Endocrinology & Metabolism · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueParathyroid Disorders and Treatments
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthUniversità di PisaUniversità degli Studi di ParmaUniversità degli Studi di FirenzeUniversità degli Studi di PadovaCedars-Sinai Medical Center
Mots-clésCalcium-sensing receptorAlleleSingle-nucleotide polymorphismPromoterTransfectionCalciumBiologyMolecular biologyGeneLuciferaseKidney stonesGenotypeGene expressionEndocrinologyInternal medicineCalcium metabolismGeneticsMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: CaSR gene is a candidate for calcium nephrolithiasis. Single-nucleotide polymorphisms (SNPs) encompassing its regulatory region were associated with calcium nephrolithiasis. AIMS: We tested SNPs in the CaSR gene regulatory region associated with calcium nephrolithiasis and their effects in kidney. SUBJECTS AND METHODS: One hundred sixty-seven idiopathic calcium stone formers and 214 healthy controls were genotyped for four CaSR gene SNPs identified by bioinformatics analysis as modifying transcription factor binding sites. Strontium excretion after an oral load was tested in 55 stone formers. Transcriptional activity induced by variant alleles at CaSR gene promoters was compared by luciferase reporter gene assay in HEK-293 and HKC-8 cells. CaSR and claudin-14 mRNA levels were measured by real-time PCR in 107 normal kidney medulla samples and compared in patients with different CaSR genotype. RESULTS: Only rs6776158 (A>G), located in the promoter 1, was associated with nephrolithiasis. Its minor G allele was more frequent in stone formers than controls (37.8% vs 26.4%, P = .001). A reduced strontium excretion was observed in GG homozygous stone formers. Luciferase fluorescent activity was lower in cells transfected with the promoter 1 including G allele at rs6776158 than cells transfected with the A allele. CaSR mRNA levels were lower in kidney medulla samples from homozygous carriers for the G allele at rs6776158 than carriers for the A allele. Claudin-14 mRNA levels were also lower in GG homozygous subjects. CONCLUSIONS: Minor allele at rs6776158 may predispose to calcium stones by decreasing transcriptional activity of the CaSR gene promoter 1 and CaSR expression in kidney tubules.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,775
Score d'incertitude au seuil0,634

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,070
Tête enseignante GPT0,356
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations56
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe Journal of Clinical Endocrinology & MetabolismMême sujetParathyroid Disorders and TreatmentsTravaux en français237 207