Protein trans-Splicing and Cyclization by a Naturally Split Intein from the dnaE Gene ofSynechocystis Species PCC6803
Notice bibliographique
Résumé
A naturally occurring split intein from the dnaE gene of Synechocystis sp. PCC6803 (Ssp DnaE intein) has been shown to mediate efficient in vivo and in vitro trans-splicing in a foreign protein context. A cis-splicing Ssp DnaE intein construct displayed splicing activity similar to the trans-splicing form, which suggests that the N- and C-terminal intein fragments have a high affinity interaction. An in vitro trans-splicing system was developed that used a bacterially expressed N-terminal fragment of the Ssp DnaE intein and either a bacterially expressed or chemically synthesized intein C-terminal fragment. Unlike artificially split inteins, the Ssp DnaE intein fragments could be reconstituted in vitro under native conditions to mediate splicing as well as peptide bond cleavage. This property allowed the development of an on-column trans-splicing system that permitted the facile separation of reactants and products. Furthermore, the trans-splicing activity of the Ssp DnaE intein was successfully applied to the cyclization of proteins in vivo. Also, the isolation of the unspliced precursor on chitin resin allowed the cyclization reaction to proceed in vitro. The Ssp DnaE intein thus represents a potentially important protein for in vivo and in vitro protein manipulation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».