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Enregistrement W1977880538 · doi:10.1136/jmedgenet-2012-101141

Public funding for genomics: where does Canada stand?

2012· article· en· W1977880538 sur OpenAlexaffabout
Constantin Polychronakos

Notice bibliographique

RevueJournal of Medical Genetics · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEthics in Clinical Research
Établissements canadiensMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGenomicsBiologyComputational biologyGeneticsGenomeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

After more than six years of funding exclusive projects in forestry and agriculture, Genome Canada has now announced a $67.5 million funding competition for large-scale genomics projects in human health, with focus on personalised medicine.i The human genomics community of this country understandably rejoiced at this long overdue announcement that gives them, for the first time in years, the means to compete internationally (http://www.genomecanada.ca/en/portfolio/research/2012-competition.aspx). Canada has been fairly generous in funding human-health related research but mostly through the Canadian Institutes of Health Research (CIHR) or the Canada Foundation for Innovation, neither of which has within its mandate to fund the type of specific multimillion-dollar project that is usually thought of as genomics. The typical CIHR grant, for example, rarely exceeds $1 million (200 000 over 5 years) in direct costs. The elation over the announcement of this funding opportunity in late 2011 soon gave way to sober reflection when prospective applicants started looking at the fine print. The terms of reference made it clear that this is a call for proposals with a very strong utilitarian angle, ‘capable of concrete deliverables by the end of the funding period that will have clinical utility and/or practical applicability’ and ‘social and/or economic benefits … realised within a short time-frame after the end of the project’, to quote from the official announcement. The funding period is four years (only coincidentally, I am sure, the time to the next federal election). How short the additional ‘short time-frame’ might be, is left to interpretation but the context leaves little doubt that it cannot be more than a couple of years. How else can applicants ‘… demonstrate end-user engagement in the development and execution of the research plan’? Examples of end-users whose interest must be attracted sufficiently for them to participate in the ‘execution of the research’ and be …

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,020
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,055
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Incitatifs · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,980
Score d'incertitude au seuil0,973

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0200,055
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0040,009
Études des sciences et des technologies0,0230,014
Communication savante0,0370,019
Science ouverte0,0050,010
Intégrité de la recherche0,0190,019
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0410,007

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,529
Tête enseignante GPT0,545
Écart entre enseignants0,015 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
DomaineIncitatifs
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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