Novel, Potent ORL-1 Receptor Agonist Peptides Containing α-Helix-Promoting Conformational Constraints
Notice bibliographique
Résumé
The ORL-1 receptor has recently been cloned and is implicated in a wide variety of physiological and pathophysiological processes. Toward the goal of elucidating important features of the receptor-bound conformation of the endogenous ligand, nociceptin (NC), several conformationally constrained analogues were prepared. Either alpha-aminoisobutyric acid (Aib) or N-methylalanine (MeAla) were inserted as replacement(s) for Ala7, Ala11, or Ala15 in the native NC sequence (FGGFTGARKSARKLANQ). In vitro assays measuring human ORL-1 receptor affinity (competition binding against [3H] NC), functional potency ([35S]GTP gamma S), and efficacy (as compared to NC) were performed for each new peptide. The receptor affinities of the Aib-containing peptides generally matched NC, showing K(i)'s in the range of 0.1-0.5 nM. By comparison, the receptor affinities of the MeAla-containing peptides were significantly diminished. Peptide 14 (FGGFTG[Aib]RKS[Aib]RKLANQ-NH2), which contains two constrained alanine residues (positions 7 and 11) and a C-terminal amide modification, was found to be a very potent agonist with K(i) = 0.05 nM and EC50 = 0.08 nM in the human ORL-1 assays. The data support a hypothesis that the receptor-bound form of NC might adopt an amphipathic helix in the "address" segment of the sequence.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».