Genetic and Morphological Evidence that <i>Phoma sclerotioides</i>, Causal Agent of Brown Root Rot of Alfalfa, Is Composed of a Species Complex
Notice bibliographique
Résumé
Phoma sclerotioides, causal agent of brown root rot of alfalfa, causes severe root and crown lesions on alfalfa and other perennial forage legumes in regions with harsh winters. Isolates of P. sclerotioides exhibit diverse cultural morphologies on potato dextrose agar (PDA), suggesting that they may exhibit a high degree of genetic diversity. To investigate the genetic relatedness of P. sclerotioides isolates, 154 isolates from North America were sequenced at 10 loci. Maximum parsimony and maximum likelihood analyses of the complete 10-locus data set placed isolates into multiple strongly supported clades, and analyses of gene-jackknife and single-gene partitions of the data set indicated robust support for six major clades and three subclades. Genetic differences corresponded closely to differences in conidial size and septation, pycnidial neck length, mycelial pigmentation, and growth rate in axenic culture at 18 and 25°C. Isolates exhibited morphologies broadly consistent with the species description of P. sclerotioides, and new species were not designated. On the basis of genetic and morphological differences, we propose establishing seven infraspecific varieties within P. sclerotioides: P. sclerotioides var. sclerotioides, champlainii, viridis, obscurus, steubenii, macrospora, and saskatchewanii. All varieties of P. sclerotioides caused brown root rot of alfalfa and grew well at low temperatures.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».