Sequence and expression of a constitutive, facilitated glucose transporter (GLUT1) in Atlantic cod<i>Gadus morhua</i>
Notice bibliographique
Résumé
A putative glucose transporter, GLUT1, is reported for Atlantic cod Gadus morhua. A combination of RT-PCR, RLM-RACE and genome walking were used to articulate a 4560 bp cDNA (GenBank accession number AY526497). It contains a 149 bp 5' UTR, a 1470 bp open reading frame and a 2941 bp 3' UTR. At the nucleotide level, the cod GLUT1 ORF shares 78.2% sequence identity to human GLUT1 and the deduced amino acid sequence clusters with GLUT1s from rainbow trout and carp. GLUT1 transcript is highly expressed in brain, gill, heart and kidney and expressed to a lower level in at least six other tissues. Expression is evident immediately upon fertilization of eggs. Six hours of hypoxia at 40% DO(2) did not alter expression levels in brain, gill, heart or kidney. The level of expression is not substantially altered in heart during low temperature challenge, although there is a suggestion that colder temperature could lead to lower levels of expression, consistent with the concept that the cold-acclimated heart has a reduced dependence upon glucose as a metabolic fuel. Two months of starvation did not significantly alter the level of expression of GLUT1 in heart. This is in marked contrast to the rat heart where fasting leads to a substantial decrease in GLUT1 levels. Overall, there is a ubiquitous tissue distribution of GLUT1, consistent with other species, and the level of gene expression, especially in heart, is relatively constant over a range of physiological conditions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».