MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1979626899 · doi:10.1242/jeb.01346

Sequence and expression of a constitutive, facilitated glucose transporter (GLUT1) in Atlantic cod<i>Gadus morhua</i>

2004· article· en· W1979626899 sur OpenAlexafffund
Jennifer R. Hall, Tyson J. MacCormack, Catherine A. Barry, William R. Driedzic

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Biology · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueAquaculture Nutrition and Growth
Établissements canadiensMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésGLUT1GadusBiologyAtlantic codEndocrinologyInternal medicineGlucose transporterUntranslated regionGeneGeneticsMessenger RNAInsulinFisheryMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A putative glucose transporter, GLUT1, is reported for Atlantic cod Gadus morhua. A combination of RT-PCR, RLM-RACE and genome walking were used to articulate a 4560 bp cDNA (GenBank accession number AY526497). It contains a 149 bp 5' UTR, a 1470 bp open reading frame and a 2941 bp 3' UTR. At the nucleotide level, the cod GLUT1 ORF shares 78.2% sequence identity to human GLUT1 and the deduced amino acid sequence clusters with GLUT1s from rainbow trout and carp. GLUT1 transcript is highly expressed in brain, gill, heart and kidney and expressed to a lower level in at least six other tissues. Expression is evident immediately upon fertilization of eggs. Six hours of hypoxia at 40% DO(2) did not alter expression levels in brain, gill, heart or kidney. The level of expression is not substantially altered in heart during low temperature challenge, although there is a suggestion that colder temperature could lead to lower levels of expression, consistent with the concept that the cold-acclimated heart has a reduced dependence upon glucose as a metabolic fuel. Two months of starvation did not significantly alter the level of expression of GLUT1 in heart. This is in marked contrast to the rat heart where fasting leads to a substantial decrease in GLUT1 levels. Overall, there is a ubiquitous tissue distribution of GLUT1, consistent with other species, and the level of gene expression, especially in heart, is relatively constant over a range of physiological conditions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2004
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Experimental BiologyMême sujetAquaculture Nutrition and GrowthTravaux en français237 207