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Enregistrement W1980420968 · doi:10.1158/1538-7445.am2011-4703

Abstract 4703: Mitochondrial DNA mutations affect respiratory complex-I in never-smoker lung cancer patients and contribute to lung cancer cell growth

2011· article· en· W1980420968 sur OpenAlexaff
Santanu Dasgupta, Ethan Soudry, Chunbo Shao, Nitai D. Mukhopadhyay, John Yee, Stephen Lam, Wan L. Lam, Paul B. Fisher, David Sidransky

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMitochondrial DNALung cancerCancerMedicineLungInternal medicineOncologySomatic cellGenotypeMitochondrionPathologyGastroenterologyBiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Lung cancer is a deadly disease worldwide with smoking being the most important risk factor. In the United States, it is estimated that there will be over 222,550 cases of lung cancer resulting in 157,300 deaths in 2010. Despite significant improvement in therapeutic modalities, the overall 5-year survival rate is still only 15%. The high morbidity is due to the lack of early detection and therapeutic intervention. Other than nuclear genetic alterations, mitochondrial DNA mutations were reported in different human cancers and implicated to have a potential role in biomarker development. However, mtDNA alteration patterns and their potential involvement are unknown in lung cancer patients that have never smoked. In the present study, we sequenced the entire mitochondrial genome and measured the mtDNA content index by quantitative PCR in 60 lung cancer patients. Of the 60 patients, 30 never smoked and the remaining 30 patients were current smokers. Forty five percent of patients (27/60) displayed at least one somatic mtDNA mutation and a total of 41 mutations were detected which were mostly homoplasmic in nature. Strikingly, mtDNA mutations were significantly higher (P=0.0025) among the non-smokers as compared to the current smoking lung cancer patients and these mutations significantly affected (P=0.025) mitochondria encoded respiratory complex-I. The patients of Asian origin also had significantly higher (P=0.015) mtDNA mutations compared to the Caucasian patient populations. The mtDNA content index also significantly increased (P=0.037) in the non-smokers compared to the smoker lung cancer patients. Forced overexpression of a frequently observed mtDNA mutation from the ND5 gene of respiratory complex-I resulted in increased superoxide production, in vitro proliferation and invasion of lung cancer cells. Frequent mtDNA alterations are detectable in non-smoker lung cancer patients and may contribute to lung cancer progression. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 102nd Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2011 Apr 2-6; Orlando, FL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2011;71(8 Suppl):Abstract nr 4703. doi:10.1158/1538-7445.AM2011-4703

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,058
Tête enseignante GPT0,378
Écart entre enseignants0,320 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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