MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1980895620 · doi:10.1002/cmdc.200890000

Cover Picture: CMP‐Pseudaminic Acid is a Natural Potent Inhibitor of PseB, the First Enzyme of the Pseudaminic Acid Pathway in <i>Campylobacter jejuni</i> and <i>Helicobacter pylori</i> (ChemMedChem 1/2008)

2008· paratext· en· W1980895620 sur OpenAlexaff
David J. McNally, Ian C. Schoenhofen, R. Scott Houliston, Nam Huan Khieu, Dennis M. Whitfield, Susan M. Logan, Harold C. Jarrell, Jean‐Robert Brisson

Notice bibliographique

RevueChemMedChem · 2008
Typeparatext
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueMicrobial Metabolites in Food Biotechnology
Établissements canadiensInstitute for Biological Sciences
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCampylobacter jejuniHelicobacter pyloriEnzymeChemistryGlycanStereochemistryDocking (animal)MicrobiologyNuclear magnetic resonance spectroscopyBiochemistrySialic acidVirulenceCampylobacterActive siteBiofilmBacteriaBiologyGlycoproteinGeneMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The cover picture shows the six enzymes (Pse B, C, H, G, I, F) responsible for producing CMP-pseudaminic acid (CMP-Pse) starting from UDP-GlcNAc in Campylobacter jejuni and Helicobacter pylori. These pathogens modify their flagella with sialic acid-like sugars such as pseudaminic acid (Pse) which are required for flagellar assembly, motility, and hence virulence. Pse B plays a central role in Pse biosynthesis and is also thought to be implicated in other glycan pathways making it a prime therapeutic target. Saturation transfer difference nuclear magnetic resonance spectroscopy (STD NMR) was used to determine binding epitopes for Pse B and to characterize Pse B inhibition with CMP-Pse at the molecular level. Docking studies and CORCEMA calculations validated STD NMR results and revealed that CMP-Pse and UDP-GlcNAc adopt similar conformations within the Pse B active site. These findings will guide the development of small-molecule inhibitors as a means to pharmaceutically control C. jejuni and H. pylori infections. For details, see the Communication by D. J. McNally, et al. on p. 55 ff.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Études des sciences et des technologies, Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,081
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,001
Bibliométrie0,0000,002
Études des sciences et des technologies0,0000,003
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0030,002
Intégrité de la recherche0,0030,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueChemMedChemMême sujetMicrobial Metabolites in Food BiotechnologyTravaux en français237 207