Secondary structure of human apolipoprotein A‐I(1–186) in lipid‐mimetic solution
Notice bibliographique
Résumé
The solution structure of an apoA-I deletion mutant, apoA-I(1-186) was determined by the chemical shift index (CSI) method and the torsion angle likelihood obtained from shift and sequence similarity (TALOS) method, using heteronuclear multidimensional NMR spectra of [u-(13)C, u-(15)N, u-50% (2)H]apoA-I(1-186) in the presence of sodium dodecyl sulfate (SDS). The backbone resonances were assigned from a combination of triple-resonance data (HNCO, HNCA, HN(CO)CA, HN(CA)CO and HN(COCA)HA), and intraresidue and sequential NOEs (three-dimensional (3D) and four-dimensional (4D) 13C- and 15N-edited NOESY). Analysis of the NOEs, H(alpha), C(alpha) and C' chemical shifts shows that apoA-I(1-186) in lipid-mimetic solution is composed of alpha-helices (which include the residues 8-32, 45-64, 67-77, 83-87, 90-97, 100-140, 146-162, and 166-181), interrupted by short irregular segments. There is one relatively long, irregular and mostly flexible region (residues 33-44), that separates the N-terminal domain (residues 1-32) from the main body of protein. In addition, we report, for the first time, the structure of the N-terminal domain of apoA-I in a lipid-mimetic environment. Its structure (alpha-helix 8-32 and flexible linker 33-44) would suggest that this domain is structurally, and possibly functionally, separated from the other part of the molecule.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».