MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1981429430 · doi:10.1158/1538-7445.tim2013-b12

Abstract B12: The role of stromal cells in supporting tumor-initiating cells in serous ovarian carcinoma

2013· article· en· W1981429430 sur OpenAlexaff
Ali Hussain, Jocelyn M. Stewart, Elzbieta Hyatt, Benjamin G. Neel, Laurie Ailles

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Cells and Metastasis
Établissements canadiensOntario Institute for Cancer ResearchUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCD90Stromal cellVimentinTumor microenvironmentMesenchymal stem cellCancer researchSerous fluidImmunostainingBiologyPopulationPathologyCD44CellMedicineImmunohistochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract High grade serous ovarian carcinoma has been shown to be a highly heterogeneous disease. In vivo studies demonstrate that the tumor initiating frequency (TIF) varies substantially from case to case. Nonetheless, the tumor initiating subset remains a rare population within the epithelial compartment and can be enriched using the cell surface marker CD133 (Stewart et al., PNAS, 2011). The tumor microenvironment may play a role in supporting and maintaining tumor initiating cells (TIC) through direct and/ or indirect cross talk. The contribution of the mesenchymal component of the microenvironment may prove to be essential in providing such support as has been previously shown in studies on breast and prostate cancers. We hypothesize that cancer associated fibroblasts (CAFs) serve as a niche that supports and maintains the tumorigenic potential of TICs in SOC. We have derived and established CAF lines from bulk primary tumors and characterized their phenotype through immunostaining. Those lines stained positive for mesenchymal markers (Vimentin and Alpha-SMA), and stained negative for the epithelial marker Cytokertain. A profile of surface markers expressed on the surface of these CAF lines was then generated by running a flow cytometry-based high throughput screen (HTS) for 370 known cell surface proteins. Those markers are being validated for their specificity by immunostaining, FACS, qPCR, and in vivo work. Preliminary data obtained through immunoflourescnce and FACS support the specificity of our candidate stromal marker CD90. Furthermore, FACS data show that CD90 is expressed more brightly on fibroblasts than on epithelial cells (EpCAM+) in bulk SOC cases. Consequently, CD90 has been selected for sorting stromal cells for additional validation. Quantitative PCR analysis of CD90+EpCAM- sorted populations further validates their over-expression of mesenchymal genes when compared to CD90-EpCAM+ sorted populations. Moreover, functional validation of the influence of fibroblasts on the growth of tumor cells is currently being investigated through co-injection and co-culture assays. Preliminary data show that the presence of fibroblasts better supports the growth of epithelial colonies in culture than when compared to other conditions. Interplay between the niche and a specific subset of epithelial cells may promote those cells to become more tumorigenic. Such an interaction may be dependent on direct physical contact and/or indirect cross talk. Ultimately, we aim on understanding the mechanisms that govern these interactions. Citation Format: Ali Hussain, Jocelyn Stewart, Elzbieta Hyatt, Benjamin Neel, Laurie Ailles. The role of stromal cells in supporting tumor-initiating cells in serous ovarian carcinoma. [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference on Tumor Invasion and Metastasis; Jan 20-23, 2013; San Diego, CA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2013;73(3 Suppl):Abstract nr B12.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,055
Tête enseignante GPT0,366
Écart entre enseignants0,311 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCancer ResearchMême sujetCancer Cells and MetastasisTravaux en français237 207