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Enregistrement W1981539213 · doi:10.1021/bi9020499

Role of Cysteine Residues in Thiol Modification of Acyl-CoA:Diacylglycerol Acyltransferase 2 from Yeast

2010· article· en· W1981539213 sur OpenAlexaff
Qin Liu, Rodrigo M.P. Siloto, Randall J. Weselake

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid metabolism and biosynthesis
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCysteineDiacylglycerol kinaseChemistryBiochemistryThiolActive siteSaccharomyces cerevisiaeEnzymeResidue (chemistry)Yeast

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Acyl-CoA:diacylglycerol acyltransferase (EC 2.3.1.20, DGAT or DAGAT), which catalyzes the final step in triacylglycerol biosynthesis, has at least two discrete family members (DGAT1 and DGAT2) with different physiological roles. Here we report a systematic study of the local functional and structural role of seven cysteine residues present in DGAT2 from Saccharomyces cerevisiae (ScDGAT2, also known as Dga1p) using chemical modification in combination with site-directed mutagenesis. We demonstrate that although DGAT2 was susceptible to various thiol-modifying reagents, none of the cysteines were directly involved in the catalytic activity. Analysis of the accessibility of the sulfhydryl groups revealed that cysteines are also not involved in formation of intramolecular disulfide linkages. Inhibition of DGAT activity with thiol-specific reagents was localized to cysteine 314, which was found to be in the proximity of a highly conserved motif of DGAT2. Our work indicates that although this cysteine does not play a role in enzymatic catalysis, it may reside in a crucial position that is near a possible active site of DGAT2 or related to proper folding of the protein.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,000
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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