Structural Investigation of the Binding of 5‐Substituted Swainsonine Analogues to Golgi α‐Mannosidase II
Notice bibliographique
Résumé
Golgi alpha-mannosidase II (GMII) is a key enzyme in the N-glycosylation pathway and is a potential target for cancer chemotherapy. The natural product swainsonine is a potent inhibitor of GMII. In this paper we characterize the binding of 5alpha-substituted swainsonine analogues to the soluble catalytic domain of Drosophila GMII by X-ray crystallography. These inhibitors enjoy an advantage over previously reported GMII inhibitors in that they did not significantly decrease the inhibitory potential of the swainsonine head-group. The phenyl groups of these analogues occupy a portion of the binding site not previously seen to be populated with either substrate analogues or other inhibitors and they form novel hydrophobic interactions. They displace a well-organized water cluster, but the presence of a C(10) carbonyl allows the reestablishment of important hydrogen bonds. Already approximately tenfold more active against the Golgi enzyme than the lysosomal enzyme, these inhibitors offer the potential of being extended into the N-acetylglucosamine binding site of GMII for the creation of even more potent and selective GMII inhibitors.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».