MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1981809104 · doi:10.1021/ac303772m

Fluorescence Quenching of Graphene Oxide Integrating with the Site-Specific Cleavage of the Endonuclease for Sensitive and Selective MicroRNA Detection

2013· article· en· W1981809104 sur OpenAlexfundno aff
Yunqiu Tu, Wen Li, Ping Wu, Hui Zhang, Chenxin Cai

Notice bibliographique

RevueAnalytical Chemistry · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesPublic Health Agency of Canada
Mots-clésChemistryGrapheneCleavage (geology)FluorescenceEndonucleasemicroRNAQuenching (fluorescence)OxideNanotechnologyPhotochemistryBiophysicsDNABiochemistryGeneOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A considerable effort is currently focused on identifying microRNA (miRNA) biomarkers because they could serve for early disease diagnosis as well as for assessing the prognosis and monitoring the response to treatment. The efficient use of the biomarkers requires precise analysis of miRNAs. This work reports a rapid, sensitive, and selective miRNA assay by coupling the fluorescence quenching of graphene oxide (GO) with site-specific cleavage of an endonuclease. The method is developed by designing a single-stranded probe that carries both a binding region responsible for facilitating the interaction with GO, which induces fluorescence quenching of the 5'-terminus-labeled fluorophore (FAM, 6-carboxyfluorescein), and a sensing region for specifically recognizing the target and hybridizing with it to form a duplex. The duplex is released from the GO surface through cleavage of RsaI endonuclease, resulting in fluorescence recovery, which shows a trend in the target concentration. The assay can detect down to ∼3.0 fM miR-126 with a linear range of 4 orders of magnitude and has an ability to discriminate the target sequence from even single-base mismatched sequence or other miRNA sequences. Moreover, it can also be used for estimating the miR-126 expressions in cells. The advantage of this assay is that it operates via the detection of the recovered fluorescence signal, which is a combined result of the specific hybridization and the site-specific cleavage, and thus should be impervious to false signals arising due to the nonspecific adsorption of interferants. It could be a great potential tool for selective analysis of miRNAs in cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,264

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations71
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueAnalytical ChemistryMême sujetAdvanced biosensing and bioanalysis techniquesTravaux en français237 207