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Enregistrement W1982084523 · doi:10.1139/w09-034

Comparison of media used to evaluate<i>Rhizobium leguminosarum</i>bivar<i>viciae</i>for phosphate-solubilizing ability

2009· article· en· W1982084523 sur OpenAlexaffvenue
Jia Xie, J. Diane Knight, Mary Leggett

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLegume Nitrogen Fixing Symbiosis
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMannitolRhizobium leguminosarumPhosphateYeast extractFood scienceLiquid mediumMicrobiologyChemistryBiologyChromatographyBiochemistryBacteriaFermentationRhizobiaceae

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Rhizobium leguminosarum is well known for its ability to fix nitrogen (N). In addition, its capacity to solubilize phosphate (Ph) has been receiving attention in recent years. Our ultimate objective was to select a R. leguminosarum bv. viciae isolate with superior Ph-solubilizing ability. The first step was to identify a culture medium that is sensitive and effective in identifying the ability of R. leguminosarum bv. viciae isolates to solubilize Ph. Thirty isolates were evaluated for Ph solubilization in broth and on solid formulations of three media: yeast mannitol extract (YEM), National Botanical Research Institute phosphate nutrient medium (MNBRI), and Pikovskaya phosphate medium (PVK). All media contained 5 g/L CaHPO4 as the only phosphorus (P) source. All 30 isolates increased the Ph concentration in liquid cultures, but the amount of Ph released into solution by individual isolates varied from one medium to another. In contrast, only a subset of the 30 isolates solubilized Ph on the solid cultures. Furthermore, some of the isolates that were able to solubilize Ph were only able to do so on a single medium. Regression analysis revealed no relationship between the Ph concentration in the liquid media and the zones of clearing on the solid media (p > 0.05). Although the pH of all of the liquid media dropped after 12 days of growth of the isolates, a relationship between Ph concentration and pH existed only for the MNBRI medium (r2 = 0.485, p < 0.001). Increasing the amount of N in the MNBRI medium from 0.1 g/L of (NH4)2SO4 to 0.5 g/L of (NH4)2SO4 did not affect the amount of Ph in solution, but it profoundly reduced the survival of the R. leguminosarum by approximately 50-fold. Consequently, the surviving bacteria were either more efficient at solubilizing Ph in the high N media or organic acids released from the lysis of the dead cells solubilized the CaHPO4 source.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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