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Enregistrement W1982271612 · doi:10.1002/chem.200701411

Self‐Assembly of N<sup>2</sup>‐Modified Guanosine Derivatives: Formation of Discrete G‐Octamers

2007· article· en· W1982271612 sur OpenAlexaff
Sanela Martić, Xiangyang Liu, Suning Wang, Gang Wu

Notice bibliographique

RevueChemistry - A European Journal · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueMolecular Sensors and Ion Detection
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryGuanosineHistone octamerRandom hexamerLigand (biochemistry)CrystallographyStackingStereochemistryMonomerMoleculeReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In the presence of Na(+) ions, two N(2)-modified guanosine derivatives, N(2)-(4-n-butylphenyl)-2',3',5'-O-triacetylguanosine (G1) and N(2)-(4-pyrenylphenyl)-2',3',5'-O-triacetylguanosine (G2), are found to self-associate into discrete octamers that contain two G-quartets and a central ion. In each octamer, all eight guanosine molecules are in a syn conformation and the two G-quartets are stacked in a tail-to-tail fashion. On the basis of NMR spectroscopic evidence, we hypothesize that the pi-pi-stacking interaction between the N(2)-side arms (phenyl in G1 and pyrenyl in G2) can considerably stabilize the octamer structure. For G1, we have used NMR spectroscopic saturation-transfer experiments to monitor the kinetic ligand exchange process between monomers and octamers in CD(3)CN. The results show that the activation energy (E(a)) of the ligand exchange process is 31 +/-5 kJ mol(-1). An Eyring analysis of the saturation transfer data yields the enthalpy and entropy of activation for the transition state: DeltaH(not =)=29 +/-5 kJ mol(-1) and DeltaS(not =)=-151 +/-10 J mol(-1) K(-1). These results are consistent with an associative mechanism for ligand exchange.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,056
Score d'incertitude au seuil0,857

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations38
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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