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Enregistrement W1982832616 · doi:10.1080/01635581.2012.711418

Vitamin D Intake Is Negatively Associated with Promoter Methylation of the Wnt Antagonist Gene<i>DKK1</i>in a Large Group of Colorectal Cancer Patients

2012· article· en· W1982832616 sur OpenAlexafffundabout
James B. Rawson, Zhouyu Sun, Elizabeth Dicks, Darshana Daftary, Patrick S. Parfrey, Roger C. Green, Steven Gallinger, John McLaughlin, Peter Wang, Julia A. Knight, Bharati Bapat

Notice bibliographique

RevueNutrition and Cancer · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensPublic Health OntarioOntario Institute for Cancer ResearchMemorial University of NewfoundlandMount Sinai HospitalLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteUniversity Health NetworkUniversity of TorontoCancer Care Ontario
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésDNA methylationEpigeneticsDKK1Wnt signaling pathwayBody mass indexColorectal cancerInternal medicineMethylationMedicineEndocrinologyMTRRVitamin D and neurologyCancerBiologyPhysiologyOncologyGeneGeneticsMethylenetetrahydrofolate reductaseAlleleGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Diet and lifestyle influence colorectal cancer (CRC) risk but the molecular events that mediate these effects are poorly characterized. Several dietary and lifestyle factors can modulate DNA methylation suggesting that they may influence CRC risk through epigenetic regulation of cancer-related genes. The Wnt regulatory genes DKK1 and Wnt5a are important contributors to colonic carcinogenesis and are often silenced by promoter hypermethylation in CRC; however, the dietary contributions to these events have not been explored. To investigate the link between dietary/lifestyle factors and epigenetic regulation of these Wnt signaling genes, we assessed promoter methylation of these genes in a large cohort of Canadian CRC patients from Ontario (n = 549) and Newfoundland (n = 443) and examined associations to dietary/lifestyle factors implicated in CRC risk and/or DNA methylation including intake of vitamins, fats, cholesterol, fiber, and alcohol as well as body mass index (BMI), and smoking status. Several factors were associated with methylation status including alcohol intake, BMI, and cigarette smoking. Most significantly, however, dietary vitamin D intake was strongly negatively associated with DKK1 methylation in Newfoundland (P = 0.001) and a similar trend was observed in Ontario. These results suggest that vitamin D and other dietary/lifestyle factors may alter CRC risk by mediating extracellular Wnt inhibition.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,033
Score d'incertitude au seuil0,236

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations57
Publié2012
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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