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Enregistrement W1983307326 · doi:10.1093/nar/gkh742

Essential structural and functional determinants within the forkhead domain of FOXC1

2004· article· en· W1983307326 sur OpenAlex
Ramsey A. Saleem

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueNucleic Acids Research · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFOXO transcription factor regulation
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchAlberta Heritage Foundation for Medical ResearchFondation pour la Recherche MédicaleUniversity of Alberta
Mots-clésTransactivationBiologyForkhead Transcription FactorsTranscription factorGeneticsAmino acidDNA-binding domainTranscription (linguistics)Protein structureDNADNA-binding proteinComputational biologyGeneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The forkhead domain (FHD)-containing developmental transcription factor FOXC1 is mutated in patients presenting with Axenfeld-Rieger malformations. In this paper, we report the introduction of positive, negative or neutral charged amino acids into critical positions within the forkhead domain of FOXC1 in an effort to better understand the essential structural and functional determinants within the FHD. We found that FOXC1 is intolerant of mutations at I87. Additionally, alterations of amino acids within alpha-helix 1 of the FOXC1 FHD affected both nuclear localization and transactivation. Amino acids within alpha-helix 3 were also found to be necessary for transactivation and can have roles in correct localization. Interestingly, changing amino acids within alpha-helix 3, particularly R127, resulted in altered DNA-binding specificity and granted FOXC1 the ability to bind to a novel DNA sequence. Given the limited topological variation of FHDs, due to the high conservation of residues, we anticipate that models of forkhead domain function derived from these data will be relevant to other members of the FOX family of transcription factors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,276
Score d'incertitude au seuil0,214

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,321
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle